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laozhang1995

新虫 (小有名气)

[求助] GAUSSIAN在气体吸收中的应用有不懂的地方,请帮忙解答

最近在用Gaussian模拟气体吸收,吸收剂是低共熔溶剂(可理解为中性有机分子加某种阳离子和阴离子),gaussianview的具体操作已经学会了,不过关于模拟的套路仍存在如下疑惑:
1.模拟单纯分子的最优结构是否需要输入分子的键长键角等参数,还是直接画好分子结构然后运算opt就可以了?
2.已知阳离子对吸收不起作用,打算模拟的时候体系只包括有机分子和卤素阴离子,建立结构模型的时候怎么输入阴离子,是直接用卤素原子代替然后把体系电荷数设为-1就可以了吗?
3.既然gaussian能计算opt,那为什么听前辈们说还要挨个试气体分子放在不同的相对位置,直接用opt算不出来吗?
恳请各位大佬解答,也可有偿咨询!
联系QQ823334805

@jiewei 发自小木虫Android客户端
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lkk1213

新虫 (正式写手)

1.输入文件里原子坐标,已经包含了键长键角,直接opt. 2.可以按你说的做,3.opt只能找到局部的最小点,不是真正的最小点,这个与初始结构有关,所以要不断调整初始结构进行尝试。当然吸附的方式可能不唯一,端式,桥式等等,都需要尝试

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2楼2018-06-02 10:45:57
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