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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】flexX的两个问题（4金币）
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swordzj858

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】flexX的两个问题（4金币）

请教有关FlexX的两个问题：
（1）进行对接时是不是必须把配体分子delete掉？是否必须定义reference分子？
（2）在设定活性位点时，请问Add Torsion有何要求？分析结果时如何显示氢键键长？
不胜感激。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 22:05 ]
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1楼 2009-03-25 17:27:33
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popelrain

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
swordzj858(金币+1,VIP+0):Thanks 4-2 07:50
swordzj858(金币+1,VIP+0):thanks 4-6 08:46
yuhuobuku(金币+2):欢迎参加讨论
不用把配体分子delete掉，可以识别的，去水就行了。
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2楼2009-04-02 04:35:51
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qinqin837

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
swordzj858(金币+1,VIP+0):thaks 4-2 17:47
swordzj858(金币+1,VIP+0):tanks 4-6 08:46
yuhuobuku(金币+2):欢迎参加讨论
view----displayH-bonds-----dynamice-----M1,M2   可以显示对接后产生的氢键
赞一下(2人) 回复此楼
我的ID叫qinqin837，但我不是83年7月生的哦，我没那么大……
3楼2009-04-02 11:32:12
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