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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】如何采用高斯计算某一分子一个键断裂过渡态能垒
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plbfqy

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何采用高斯计算某一分子一个键断裂过渡态能垒

本人不是量化专业的，量化只懂点皮毛。想求助一个采用高斯计算某一分子某个键断裂时过渡态的能垒。
3HFeO4- + 3CH3SH →3H2FeO4- + 3CH3●                                             
问一下从理论上能否计算出CH3SH先断裂S-H 键形成CH3S●，
就是想问下下面两个分子内的键断裂，哪种最有可能发生，
CH3SH→CH3S●+●H    (1)
CH3SH→CH3●+●SH    (2)
CH3SH→●CH2SH+●H  (3)
哪位高人能指点一二，教我怎么去计算上面三个分解各自的过渡态，好知道它们谁的能垒最低。会的替我做个gjf文件，把文档发到回复里。万分感谢了！我为这个已经忙了一个星期了。

[ Last edited by lei0736 on 2009-3-25 at 20:35 ]
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1楼 2009-03-25 14:57:47
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半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家
★ ★
erylingjet(金币+2,VIP+0):感谢交流 3-25 17:49
%chk=CH4HTS
%mem=256MB
# MP2(FC)/6-311G** opt=(CalcHFFC,TS) iop(1/11=1)

TS CH4+H----CH3+H2

0 2
C1
H2 1 r1
H3 1 r2 2 a1
H4 1 r2 2 a1  3 b1
H5 1 r2 2 a1  4 b1
X6 2 r3 1 90. 5 180.
H7 2 r4 6 90. 5 180.

r1=1.5
r2=1.
r4=0.9
a1=109.
b1=120.先照着做做， CH4+H----CH3+H2，不行再说！
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2楼2009-03-25 16:05:04
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 3-26 08:43
plbfqy(金币+2,VIP+0):谢谢斑竹关注 3-30 16:27
楼上的是先猜测一个过渡态的吧,像你这个例子?
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3楼2009-03-25 17:50:40
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半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 3-25 20:35
是的上面要猜测个过渡态他这个过渡态应该很好猜试试，不行的话，来个傻瓜型的，不过易跑到别的构型去你试试：照这例子
%chk=QST2-H2CO-HCOH
# MP2/6-311G** opt=qst2 freq

QST2-H2CO-HCOH at the MP2/6-311G** level

0 1
反应物区结构描述

Title of Products

0 1
产物区结构描述
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4楼2009-03-25 18:48:26
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plbfqy

木虫 (小有名气)

好像不行啊

你传的那个文件高斯好像运行不了啊
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5楼2009-03-28 09:05:42
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半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 3-29 09:18
plbfqy(金币+8,VIP+0):虽然问题没解决，还是非常谢谢你。 3-30 16:26
你把文件粘贴过去是不是最后一行没有空格呀！如不是看看别的高手给咱看看怎么回事，格式就是这样的！！
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6楼2009-03-28 12:50:01
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