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林小伟

新虫 (小有名气)

[交流] 形成氢键数量问题

我从PDB数据库下载了一个蛋白复合物,在数据库中的二维图像中只显示出了两个氢键作用,而我对蛋白在SYBYL中重新对接后显示出4个氢键作用。求助下大概是什么原因,操作中出现的错误还是本身就不只两个氢键作用

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小伟2017

新虫 (小有名气)


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你从蛋白库下载的复合物,和你sybyl对接的可能对接环境就不同就是同一个蛋白和同一个小分子在不同软件对接可能结果也不一样,我目前也在学这个,说错了勿怪

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2楼2018-05-30 00:37:16
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林小伟

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小伟2017 at 2018-05-30 00:37:16
你从蛋白库下载的复合物,和你sybyl对接的可能对接环境就不同就是同一个蛋白和同一个小分子在不同软件对接可能结果也不一样,我目前也在学这个,说错了勿怪

没事,多少能知道一些情况,感谢解答

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3楼2018-05-30 12:45:26
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