24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 763  |  回复: 6
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

pumf

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于Discover 运算的问题

请教各位高手,我在用Discover做表面吸附动力学的时候,是否一定要将表面结构中的各个原子之间的键删除?(我要做的表面可以认为是刚性的)。谢谢啊

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 20:51 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

吸附动力学机制与模型

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 3-28 18:47
我基本没用过Discove,但对它r一直有个疑惑就是:这种原子之间的键删除是否影响计算结果。
量子计算的模块Dmol、Castep中删掉键确实只是视觉效果不同。但对于Discover这种使用力场的模块一直不太了解。我试验过删除键确实对计算结果有影响,但不清楚这里面到底是怎么处理原子间作用的。还有就是如果相互作用与这种"人为定义的键"有关,那么能否正确处理断键、成键过程呢?
4楼2009-03-25 10:51:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

vbaov

木虫 (著名写手)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 3-28 18:47
没必要删除吧,原子之间只要距离适当必然会成键的,你删除的只是一种表观上的形式而已,原子之间的键并不是因为你删除了就不存在了!你为什么要删除呢?
2楼2009-03-25 08:31:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pumf

木虫 (正式写手)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 3-28 18:47
我在做动力学的时候,如果不删除的话,在第一步优化的时候它会报错,提示我“Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: O48(o)-Al32(al3o)”,但是我如果在优化之前删掉键的话,这个错误它倒是不报了,可是还有问题,删除键后做优化,它会把我的模型从一个表面变成一个大块状的结构。
3楼2009-03-25 10:39:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 3-28 18:48
discover不能正确处理断键、成键过程,只能处理物理问题
有这个错误提示是因为成这个键的原子的力场参数没有定义或者没有合适的力场参数
不要让他自己计算,手动查看一下有没有合适的力场参数
5楼2009-03-25 13:00:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学279求调剂 +18 哈哈哈^_^ 2026-04-08 19/950 2026-04-11 12:46 by zhq0425
[考研] 327求调剂 +4 拾光任染 2026-04-06 4/200 2026-04-11 12:01 by Delta2012
[考研] 0854调剂 +8 950824he@ 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:11 by zhq0425
[考研] 298求调剂 +9 钉叮咚冬瓜 2026-04-07 11/550 2026-04-11 09:35 by zhq0425
[考研] 本科西工大 324求调剂 +4 wysyjs25 2026-04-10 4/200 2026-04-10 20:00 by 来看流星雨10
[考研] 284求调剂 +9 让我上岸吧阿西 2026-04-09 11/550 2026-04-10 19:18 by 靖jing
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 求调剂 +5 不会飞的鱼@ 2026-04-10 5/250 2026-04-10 19:07 by chemisry
[考研] 266求调剂 +29 阳阳哇塞 2026-04-07 29/1450 2026-04-10 16:20 by 高维春
[考研] 一志愿厦大生物学332求调剂 +10 池池池池池池 2026-04-08 10/500 2026-04-09 17:10 by 独醉梦孤城
[考研] 考研调剂 +13 冰冰,,, 2026-04-07 13/650 2026-04-09 17:01 by Lilly_Li
[考研] 一志愿武理车辆 281 求调剂 +5 上岸研究生. 2026-04-07 5/250 2026-04-09 15:56 by only周
[考研] 一志愿985初试354分生物调剂 +3 031001 2026-04-06 3/150 2026-04-09 00:30 by Evan_Liu
[考研] 304求调剂 +16 c297914 2026-04-05 17/850 2026-04-08 13:00 by grayjzr
[考研] 336求调剂,一志愿中科大 +9 墨彧 yuyu 2026-04-06 9/450 2026-04-08 11:24 by 想读书的菌菌
[考研] 调剂求助(生物与医药) +6 @6952 2026-04-06 6/300 2026-04-07 23:52 by lys0704
[考研] 323求调剂 +3 林zlu 2026-04-07 4/200 2026-04-07 23:21 by lbsjt
[考研] 11408 325分 +3 jgtxuxgkx 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:10 by lbsjt
[考研] 081700,311,求调剂 +17 冬十三 2026-04-04 18/900 2026-04-07 12:50 by Sammy2
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +6 cs0106 2026-04-05 6/300 2026-04-05 16:34 by imissbao
信息提示
请填处理意见