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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】计算过渡态(未解决，已放弃，谢谢大家！)
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】计算过渡态(未解决，已放弃，谢谢大家！)

有两个结构A,B，现在已经优化好了，B能量稍高，我想计算一下A——》B之间的过渡态，但是过渡态的结构未知，输入文件怎么构建？最好详细一点，谢谢！



更新：混合基组算不下去  101错误  我是把混合基组放在最后的  前面都是符合输入文件的要求的  但是计算错误  不知道该怎么办？   谢谢！

尽管没有解决，但还是谢谢各位参与讨论！

[ Last edited by nyzhaoyin on 2009-4-6 at 15:07 ]
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1楼 2009-03-24 13:20:53
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by csfn at 2009-3-31 09:53:
我只能建议你将自己的一个报错的输入文件完整的帖出来 给大家指正  希望今后所有提问的朋友都能如此 否则会白浪费双方很多时间

# b3lyp/genecp opt=QST2

TS-SH-1-2

0 2
Au
Au                 1              B1
Au                 2              B2    1              A1
Au                 3              B3    2              A2    1              D1
Au                 3              B4    2              A3    1              D2
Au                 5              B5    3              A4    2              D3
S                  5              B6    3              A5    2              D4
H                  7              B7    5              A6    3              D5

B1=2.70315082
B2=4.18915706
B3=2.71670081
B4=2.84878325
B5=2.70593056
B6=2.37316509
B7=1.34935500
A1=98.57574011
A2=42.35932727
A3=53.04858471
A4=58.53747249
A5=129.22738996
A6=96.81319198
D1=0.74384445
D2=-179.15631563
D3=179.10566172
D4=0.31850817
D5=-97.39457526

TS-SH-1-2

0 2
Au
Au                 1              B1
Au                 1              B2    2              A1
Au                 2              B3    1              A2    3              D1
Au                 3              B4    1              A3    2              D2
Au                 5              B5    3              A4    1              D3
S                  5              B6    3              A5    1              D4
H                  7              B7    5              A6    3              D5

B1=2.78884687
B2=2.73390018
B3=2.69945255
B4=2.86309907
B5=2.67630633
B6=2.39476257
B7=1.34906045
A1=61.29471961
A2=127.45773451
A3=176.03934011
A4=58.73122257
A5=113.04501917
A6=96.79487893
D1=-2.48677451
D2=18.76805466
D3=162.22716841
D4=-16.46320452
D5=-96.58770506

H S 0
6-311+G(3df)
****
Au  0
LANL2DZ
****

Au  0
LANL2DZ

能不能帮我调一下  调好了给我啊？  谢谢！

[ Last edited by nyzhaoyin on 2009-3-31 at 14:25 ]
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14楼2009-03-31 14:24:36
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半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家
★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):3Q! 3-25 00:05
可以猜测一个过渡太分子构型，然后，按照此法做：
%mem=6MW
%nproc=1
# hf/3-21g opt=(ef,ts) freq

Title Card Required

0 1
猜测过渡态分子描述
出现虚频说明过渡太找到！试试！若还不行我给你发个我的例子！
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2楼2009-03-24 13:42:04
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 半支烟5591 at 2009-3-24 13:42:
可以猜测一个过渡太分子构型，然后，按照此法做：
%mem=6MW
%nproc=1
# hf/3-21g opt=(ef,ts) freq

Title Card Required

0 1
猜测过渡态分子描述
出现虚频说明过渡太找到！试试！若还不行我给你发个我 ...

这个过渡态初始构型不容易猜啊   A,B差别不是很大   初始构型确实想不到该怎么构造

输入文件该怎么搞？   你上面给我说的  好像没有A,B的结构啊  难道计算过渡态的时候在输入文件中不需要A,B吗？  

如果可以给我发个例子吧，谢谢！
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3楼2009-03-24 14:10:46
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Jenny0428

银虫 (小有名气)
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 3-25 00:05
如果 A,B差别不是很大，直接猜测有困难，可以输入这两个分子的结构采取qst2的方法进行寻找 具体输入方法可参考高斯说明书
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4楼2009-03-24 16:27:03
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