| 查看: 406 | 回复: 3 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 xchboss 的 3 个金币 | |||
[交流]
【求助】相互作用能模拟
|
|||
|
溶剂分子和溶质分子相互作用能模拟过程是否如下？请各位好手指教 1）首先，建各自分子结构，优化 2）然后，分别对纯溶剂、纯溶质以及溶剂-溶质混合体系建周期性盒子。 3）其次，跑动力学。这里系综怎么选取？到底该用NVT5ps+NVT200ps,还是NVT5ps+NPT200ps，还是直接NPT200ps? 4）提取数据。这个地方该用轨迹文件中的non-bond平均值，还是将动力学最后一帧拷贝出来直接Energy？或是其他 5）根据公式 溶剂和溶质之间的相互作用能= 溶剂-溶质混合体系作用能--溶剂作用能--溶质作用能 不知道以上的模拟过程，还有其中的一些具体操作有无特别注意的地方，请各位大侠帮忙？ [ Last edited by lei0736 on 2009-3-26 at 08:48 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
基金正文30页指的是报告正文还是整个申请书
已经有9人回复
-
哈尔滨工业大学（深圳）绿色化学团队招收2026年秋季入学博士生
已经有11人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有277人回复
-
澳大利亚昆士兰科技大学PhD博士奖学金
已经有0人回复
-
【211博士招生】环境化学、地学、毒理方向，擅长污染物迁移转化降解、计算模拟者优先
已经有17人回复
-
求助如何利用vasp计算磁光克尔效应
已经有1人回复
-
070300总分298求调剂
已经有2人回复
-
一志愿厦门大学化学学硕307求调剂
已经有13人回复
-
理论与计算化学方向调剂——初试388分（数学144）
已经有1人回复
-
硕士研究生调剂
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
nkyx
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 9431.2
- 散金: 12
- 红花: 4
- 帖子: 644
- 在线: 2271.7小时
- 虫号: 321349
- 注册: 2007-03-10
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2009-03-24 12:03:02
xuefei06
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.18
- 金币: 1957.8
- 红花: 1
- 帖子: 303
- 在线: 384.4小时
- 虫号: 424222
- 注册: 2007-07-21
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
3楼2009-03-25 00:15:53
qixingbao07
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4025.6
- 红花: 6
- 帖子: 595
- 在线: 164.1小时
- 虫号: 551931
- 注册: 2008-04-28
- 专业: 药物设计与药物信息
4楼2009-03-25 09:25:11
