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wgfz1979

铜虫 (正式写手)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 159.9
散金: 30
红花: 7
帖子: 661
在线: 173.2小时
虫号: 549156
注册: 2008-04-20
性别: GG
专业: 配位化学

[交流] 求助CIF的AB类错误

晶体的AB类错误太多!

貌似相近,有哪位大虾,不吝赐教!

PLAT721_ALERT_1_A Bond Calc    1.04000, Rep    0.93000 Dev...    0.11 Ang.
            C20  -H20    1.555 1.555
PLAT721_ALERT_1_A Bond Calc    1.00000, Rep    0.93000 Dev...    0.07 Ang.
            C20' -H20' 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    105.00, Rep    109.50 Dev...    4.50 Deg.
            C19  -O8 -H8    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    134.00, Rep    125(10) Dev...    9.00 Deg.
            O8 -C19  -C20    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    108.00, Rep    115(10) Dev...    7.00 Deg.
            O8 -C19  -C18    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    127.00, Rep    118(10) Dev...    9.00 Deg.
            C19  -C20  -C15    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    116.00, Rep    120.90 Dev...    4.90 Deg.
            C19  -C20  -H20    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    116.00, Rep    120.90 Dev...    4.90 Deg.
            C15  -C20  -H20    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    113.00, Rep    119(10) Dev...    6.00 Deg.
            C20' -C19' -C18' 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    129.00, Rep    124(10) Dev...    5.00 Deg.
            C20' -C19' -O8'    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    127.00, Rep    119(10) Dev...    8.00 Deg.
            C19' -C20' -C15' 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    116.00, Rep    120.30 Dev...    4.30 Deg.
            C19' -C20' -H20' 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_A Angle Calc    117.00, Rep    120.30 Dev...    3.30 Deg.
            C15' -C20' -H20' 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -4.00, Rep       1.00 Dev...    5.00 Sigma
            C16 -C17 -C18 -C19 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -172.00, Rep    17.00 Dev...    171.00 Sigma
            C17 -C18 -C19 -O8    1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    174.00, Rep    18.00 Dev...    156.00 Sigma
            O8  -C19 -C20 -C15 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc       4.00, Rep       0.00 Dev...    4.00 Sigma
            C18 -C19 -C20 -C15 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -5.00, Rep       0.00 Dev...    5.00 Sigma
            C16 -C15 -C20 -C19 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    178.00, Rep    18.00 Dev...    160.00 Sigma
            C14 -C15 -C20 -C19 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -177.00, Rep    18.00 Dev...    165.00 Sigma
            C13'-C14'-C15'-C20' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    177.00, Rep    18.00 Dev...    159.00 Sigma
            C20'-C15'-C16'-C11' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc       4.00, Rep       0.00 Dev...    4.00 Sigma
            C17'-C18'-C19'-C20' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    175.00, Rep    18.00 Dev...    157.00 Sigma
            C17'-C18'-C19'-O8' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -7.00, Rep       0.00 Dev...    7.00 Sigma
            C18'-C19'-C20'-C15' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -176.00, Rep    18.00 Dev...    166.00 Sigma
            O8' -C19'-C20'-C15' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc       6.00, Rep       0.00 Dev...    6.00 Sigma
            C16'-C15'-C20'-C19' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -176.00, Rep    18.00 Dev...    166.00 Sigma
            C14'-C15'-C20'-C19' 1.555 1.555 1.555 1.555
________________________________________
Alert level B
PLAT242_ALERT_2_B Check Low    Ueq as Compared to Neighbors for       S1
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D    H12D ..  H15F ..    1.85 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    O12 -  *H12B ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    O12 -  *H12C ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    O13 - H13C ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    >O15 -  >H15E ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    >O15 -  >H15F ...       ?
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc    118.00, Rep    121(10) Dev...    3.00 Deg.
            C16  -C15  -C20    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc    118.00, Rep    121(10) Dev...    3.00 Deg.
            C17  -C18  -C19    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc    122.00, Rep    119.60 Dev...    2.40 Deg.
            C19  -C18  -H18    1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc    118.00, Rep    121(10) Dev...    3.00 Deg.
            C16' -C15' -C20' 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc    124.00, Rep    121(10) Dev...    3.00 Deg.
            C20' -C15' -C14' 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_B Torsion Calc    177.00, Rep    180(26) Dev...    3.00 Sigma
            C13 -C14 -C15 -C20 1.555 1.555 1.555 1.555

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1楼 2009-03-23 17:16:16

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cxsky315

至尊木虫 (著名写手)

小木虫华南地区特派专员

应助: 4 (幼儿园)
贵宾: 2.149
金币: 11016.6
散金: 693
红花: 5
帖子: 1692
在线: 361.1小时
虫号: 319501
注册: 2007-03-08
性别: GG
专业: 合成药物化学

★
warlen(金币+1,VIP+0):3Q~ 3-26 11:19

PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc       4.00, Rep       0.00 Dev...    4.00 Sigma
            C17'-C18'-C19'-C20' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    175.00, Rep    18.00 Dev...    157.00 Sigma
            C17'-C18'-C19'-O8' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -7.00, Rep       0.00 Dev...    7.00 Sigma
            C18'-C19'-C20'-C15' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -176.00, Rep    18.00 Dev...    166.00 Sigma
            O8' -C19'-C20'-C15' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc       6.00, Rep       0.00 Dev...    6.00 Sigma
            C16'-C15'-C20'-C19' 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT723_ALERT_1_A Torsion Calc    -176.00, Rep    18.00 Dev...    166.00 Sigma
            C14'-C15'-C20'-C19' 1.555 1.555 1.555 1.555
.ins中加conf

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Love is a lamp,while friendship is the shadow.When the lamp is off,you will find the shadow everywhere.Friend is who can give you streng that last.

4楼2009-03-26 10:46:06

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paopaomeng

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 4 (幼儿园)
贵宾: 1.163
金币: 35.5
散金: 3769
红花: 2
帖子: 1254
在线: 170小时
虫号: 419785
注册: 2007-07-07
性别: GG
专业: 配位化学

★ ★ ★
wgfz1979(金币+1,VIP+0):你说的都有! 3-24 08:40
wgfz1979(金币+1,VIP+0):xiexie 3-24 08:43
wgfz1979(金币+1,VIP+0):剩下的给你了,呵呵 3-25 16:47

好像没有修完，你看看ins里加htab，bond $h等命令了吗？

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经历了“删除门”，有点晕！

2楼2009-03-23 18:42:41

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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

CMEI: 1
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红花: 22
沙发: 1
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注册: 2006-06-17
性别: GG
专业: 放射分析

氢加的也不对吧~

★ ★ ★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 3-23 19:14
wgfz1979(金币+1,VIP+0):谢谢!我想是的. 3-24 08:40
wgfz1979(金币+1,VIP+0):xiexie 3-24 08:42

PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D    H12D ..  H15F ..    1.85 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    O12 -  *H12B ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    O12 -  *H12C ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    O13 - H13C ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    >O15 -  >H15E ...       ?
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor    >O15 -  >H15F ...       ?

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3楼2009-03-23 18:48:42

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