24小时热门版块排行榜    

查看: 9346  |  回复: 22
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

qiaoqiao1223

新虫 (小有名气)


[交流] 绝对定量 qPCR 标准曲线 数据分析

最近在用qPCR测处理样品中的拷贝数,但是出现了不可避免的问题。。请教一下qPCR大神!谢谢!

我是将已知拷贝数的质粒梯度稀释,作标准曲线。用其CT值和拷贝数得到线性方程。然后将样品的CT值带入方程中,计算出样品中的拷贝数。每跑一组对照和处理,都会跑一次标曲,即同一板上有标准样品+对照组样品+处理组样品。(如:质粒中的拷贝数是10的7次方,6次方...到1次方,其CT值分别为a,b...g。在excel里将指数7,6,5,4,3,2,1和ct值a,b,c,d,e,f,g做散点图并生成线性方程,得到y=ax+b。然后将样品的ct值 X带入方程中,得到Y。这里的Y为10的指数,样品中的拷贝数为10的Y次方。)

但是这样做了几次发现,每次用标准样品得到的线性方程都会有微小的差异,算出来的处理样品中拷贝数会差很大。。请问这种误差怎么避免?(个人认为不能避免,因为每次加样会有误差,sybr效率和质粒浓度都会有微小差异。但是这种微小差异在计算的时候会被放大很多倍。我试过将同一个样品跑两次,即在两个板子上跑,用的所有东西都一样,但是最后算出的结果还是会差很多。)

我现在能想到的就是,取3组或者4组样品(因为我们的科研需要至少三次独立重复试验嘛),放在同一个板子上跑,用同一个标准样品作为参考。

但是这样做的问题就是。我的试验是不同时间点的。。我可以将A时间点的几组样品放一个板子上跑,也可以将B时间点的几组放一个板子上跑。但是,我怎么比较A和B这两个时间点的差异呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhengzheng7585

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以从以下方面考虑:用384孔板跑,或者一对一对的跑,或者用合适的统计学方法分析~
23楼2018-05-24 13:27:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 23 个回答
简单回复
dongmings8楼
2018-05-09 21:09   回复  
qiaoqiao1223(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
youngen4楼
2018-05-09 18:12   回复  
qiaoqiao1223(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 应届大龄土博教职选择,石河子大学和广西大学 10+3 茅山老道士 2024-06-10 9/450 2024-06-11 11:39 by wangtaotall
[有机交流] 旋蒸请教 +5 办公室摸鱼 2024-06-09 7/350 2024-06-11 11:10 by ghj-hebust
[食品] 食品博士导师 +3 小李醒yy 2024-06-11 4/200 2024-06-11 10:50 by 小李醒yy
[公派出国] 公派出去要准备多少钱? +7 天空之光 2024-06-06 9/450 2024-06-11 08:49 by tfang
[考博] 还能读上博士吗 +9 小伙走起 2024-06-09 15/750 2024-06-11 08:31 by 小伙走起
[硕博家园] 迷茫毕业季 +8 独孤老狗 2024-06-04 9/450 2024-06-11 08:09 by 浅唱,唱歌好听
[教师之家] 公办双非,学生论文升学就业都不行。一本大学的论文升学就业没问题吧? +5 河西夜郎 2024-06-09 5/250 2024-06-10 17:59 by yyallen2003
[基金申请] 间接经费用于绩效支持比例人员等问题 5+4 helsinglee 2024-06-07 6/300 2024-06-10 16:10 by rhhua11111
[基金申请] B口yq答辩 +6 学员qYccD0 2024-06-05 7/350 2024-06-10 16:00 by kobe0107
[基金申请] 今年香江初审出结果了吗 +5 悲催科研狗 2024-06-06 15/750 2024-06-10 15:24 by wuhanrui
[论文投稿] 审稿交流 +5 huyugan123 2024-06-08 7/350 2024-06-10 10:51 by huyugan123
[论文投稿] 美国对华为的制裁会影响英文论文发表吗 +8 楚辞mio 2024-06-04 8/400 2024-06-09 19:56 by nono2009
[有机交流] 席夫碱反应ph敏感 控制ph在多少呢? 10+4 段sy 2024-06-05 5/250 2024-06-08 23:15 by 段sy
[基金申请] 各位大佬帮忙看看F03青基5篇代表作什么水平? +7 duboytd 2024-06-04 7/350 2024-06-08 16:25 by 学员NHuqdk
[论文投稿] 求助,锂电池的3区4区英文期刊求助 +7 交界地的懒羊羊 2024-06-06 7/350 2024-06-08 02:23 by 明明在
[论文投稿] 返修之后,今天with editor状态没变,但是日期更新了,有人知道是怎么回事么? 50+3 huanpo116 2024-06-04 8/400 2024-06-05 21:44 by lucky_my2010
[论文投稿] 不要投这个杂志Journal of materials science +5 蛋蛋198956 2024-06-04 5/250 2024-06-05 18:18 by nandi2212
[基金申请] E口YQ答辩 +3 firepick 2024-06-05 3/150 2024-06-05 17:12 by kaka198888
[基金申请] 各位,F01口的YQ有收到通知的吗? +3 zmm891258 2024-06-05 5/250 2024-06-05 17:06 by godlovewho
[有机交流] 求指点这一步反应如何实现 50+4 35ghjs 2024-06-04 12/600 2024-06-05 10:51 by 35ghjs
信息提示
请填处理意见