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虫子739

铁虫 (小有名气)

[交流] RNA变性凝胶电泳

请问RNA变性凝胶电泳的方法是什么?溶液具体怎么配置?麻烦吗?MOPS的作用是什么?
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader

RNA可以使用非变性或变性凝胶电泳进行检测。在非变性电泳中,可以分离混合物中不同分子量的RNA分子,但是无法确定分子量。只有在变性情况下,RNA分子完全伸展,其泳动率才与分子量成正比甲醛变性胶:
(1)0.1%DEPC水:200ml双蒸去离子水加0.2mlDEPC焦炭酸、二乙酯混匀,室温放置过夜,高压灭菌。
(2)10x电泳缓冲液。
吗啉代丙烷磺酸(MOPS)        0.4mol/L(pH 7.0)
NaAc                           0.1mol/L
乙二胺四乙酸(EDTA)             10mmol/L
(3)50mL变性琼脂糖凝胶(1%)
(4)10x电泳缓冲液     5 mL
琼脂糖                0.5 g
0.1%DEPC水          36.5 mL
加热溶解,稍冷却,加入8.5 mL 37%甲醛。  
(5)上样缓冲液:50%甘油,1mmmol/LEDTA,0.4% 溴酚兰,0.4%二甲苯蓝。
(6)甲酰胺(去离子)。
制胶:
称取0.5g琼脂糖粉末,加入放有36.5mL的DEPC水的锥形瓶中,加热使琼脂糖完全溶解。稍冷却后加入5mL的10x电泳缓冲液、8.5mL的甲醛。然后在胶槽中灌制凝胶,插好梳子,水平放置待凝固后使用。
加样:
在一个洁净的小离心管中混合以下试剂:电泳缓冲液(10x)2μl、甲醛3.5mL、甲酰胺10mL、RNA样品3.5μl。混匀,置60℃保温10min,冰上速冷。加入3μl的上样缓冲液混匀,取适量加样于凝胶点样孔内。同时点RNA标准样品。
会当凌绝顶,一览众山小
3楼2009-03-22 03:06:26
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jqq1985

银虫 (正式写手)

恩,最近也在看这方面的文献,好像用尿素-聚丙烯酰胺凝胶的比较多
2楼2009-03-20 19:51:42
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lyf841025

银虫 (小有名气)

在配置胶时加入甲醛溶液,其余跟DNA电泳一样!
4楼2009-03-22 06:59:49
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lyf841025

银虫 (小有名气)

在配置胶时加入甲醛溶液其余跟DNA电泳一样!
5楼2009-03-22 07:01:03
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