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一时花开11

新虫 (正式写手)

[求助] NAMD跑动力学出现Low global exclusion count! 已有1人参与

在用伞状取样分析pmf出现Low global exclusion count!  (36 vs 88)  System unstable or pairlistdist or cutoff too small,这个问题不知道该如何解决,网上搜说在跑MD时要进行minimization,在此之前我已经进行过minimze,然后我又加大cutoff及pairlistdist,还是没用,有没有大神知道怎么办,我已经苦恼很久了,谢谢!!!

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jack150

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

系统初始不稳定,初始坐标有问题吧? 原子坐标重合?结构交叉?
2楼2018-04-28 11:30:16
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