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Pokelypse

铁虫 (初入文坛)

[求助] 质粒酶切后疑似降解

想请教一下虫友们,质粒抽提酶切之后条带消失怎么办?
双酶切空载pGEX-6p-1,配成30μL体系用1μL BamH I和1μL Xho I(均是Takara Quickcut限制酶)在37℃水浴酶切3h,切完只有这个条带:

http://muchongimg.xmcimg.com/oss2/img/2018/0419/bw193h4579392_1524104882_196.png


然后做了对照,两组不加限制酶但加了10×酶切buffer,一组不加限制酶和10×酶切buffer而是用灭菌水补足20体积,都是30μL体系在37℃酶切3h,结果如下:

http://muchongimg.xmcimg.com/oss2/img/2018/0419/bw113h4579392_1524104965_382.png

结果很奇怪,前两组像是被切碎了,只加水的一组没有被切碎。

以上实验重复多次,结果均相同。

提质粒用的是5mL DH5α菌液,提质粒的试剂盒也是新的,buffer DW1和wash solution都洗了3遍,用60μL灭菌1×TE洗脱。Takara quickcut酶和10×green酶切buffer都是新拆封的,枪头也是进口灭菌的。空载质粒测序结果也是正确的。

求问可能是哪里出了问题?谢谢!

质粒酶切后疑似降解
Snipaste_2018-04-18_10-10-51.png


质粒酶切后疑似降解-1
Snipaste_2018-04-18_10-18-10.png
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diy患者

铁虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-05-06 09:54:06
这个现象确实奇怪,难道buffer里有dna酶?可以把buffer加热,查一下资料,估计60度10分钟就差不多了,buffer里的东西大部分都是耐热的,加热后不影响效果。
2楼2018-05-04 15:30:29
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Pokelypse

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by diy患者 at 2018-05-04 15:30:29
这个现象确实奇怪,难道buffer里有dna酶?可以把buffer加热,查一下资料,估计60度10分钟就差不多了,buffer里的东西大部分都是耐热的,加热后不影响效果。

谢谢!我后来重新转入新制的DH5α感受态细胞,再次提质粒就没有问题了,可能是之前的DH5α菌有问题。
3楼2018-05-05 15:23:06
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起名字真难,

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Pokelypse at 2018-05-05 15:23:06
谢谢!我后来重新转入新制的DH5α感受态细胞,再次提质粒就没有问题了,可能是之前的DH5α菌有问题。...

楼主和你遇到相同的情况了,你是把提出来的质粒转到新的DH5α中,还是用新的菌株了?
4楼2021-04-21 10:47:00
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