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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 肠道微生物
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橙子～

新虫 (初入文坛)

[求助] 肠道微生物

虾肠道微生物DNA提取，因为虾是放诱饵才捕上来的，所以提肠道微生物DNA的时候可能会带入诱饵的污染，请问有什么办法可以尽量减小污染吗？感谢~
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1楼 2018-04-18 19:53:11
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)
应该没啥影响吧，菌群没那么容易改变的，不放心就做个诱饵的全菌群对照

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橙子～
2楼2018-04-18 20:03:41
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在水壹方

新虫 (小有名气)
★
小冀-: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-04-19 09:31:06
可以做个诱饵对照，或者所有的虾都是诱饵捕获的也算是经过了相同处理

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橙子～
3楼2018-04-19 00:29:52
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橙子～

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by snoopytbw at 2018-04-18 20:03:41
应该没啥影响吧，菌群没那么容易改变的，不放心就做个诱饵的全菌群对照

谢谢啦

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4楼2018-04-19 08:45:31
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橙子～

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 在水壹方 at 2018-04-19 00:29:52
可以做个诱饵对照，或者所有的虾都是诱饵捕获的也算是经过了相同处理

感谢

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5楼2018-04-19 08:46:01
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橙子～

新虫 (初入文坛)
请问你们做菌群结构是高通量测序分析的吗？因为提取的DNA需要经过PCR，所以如果肠道含有诱饵比较多的话，最后扩增出来的很多都是诱饵带来的污染菌，目标菌群反而很少扩增出来，丰度和种类上会产生偏差，所以这个诱饵菌群具体怎么做对照呢？

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6楼2018-04-19 10:00:29
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Humptykey

新虫 (初入文坛)
请问下楼主提取DNA用的是什么方法，我最近也在做，但提取效果很差，跑胶DNA弥散

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7楼2018-07-10 08:10:12
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橙子～

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by Humptykey at 2018-07-10 08:10:12
请问下楼主提取DNA用的是什么方法，我最近也在做，但提取效果很差，跑胶DNA弥散

用的是QIAGEN的power soil试剂盒提的
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8楼2018-07-21 15:53:22
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