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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP跑分子动力学，小体系能跑，大体系作业会掉，求大腿帮忙～～
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lyli2017

新虫 (小有名气)

[交流] VASP跑分子动力学，小体系能跑，大体系作业会掉，求大腿帮忙～～

KPOINTS用gamma或者不是gamma都一样。
INCAR一样的，就只能在2x2的表面跑，4x4的作业跑一步自动掉。求问解决方案，谢谢了～
体系是有机小分子覆盖在金属表面。
寻求能量最低点，想试试。
作业说killed by signal 9
请问是内存问题还是？请问怎么解决呢？
GGA = PE?????????????????? ?
?? POTIM = 2???????????????? ?????????????????
?? NPAR?? = 1
?? LPLANE = .TRUE.
------------------------------------------
Electronic Relaxation:
-----------------------------------------
?? LREAL? = Auto???????????? ?????????????????????
?? ENCUT? = 400
?? PREC?? = Normal????
?? EDIFF? = 1e-5?????????????
?? IALGO? = 48????????????
?? NELM=? 70?????????????????
?? NELMIN = 4???????????????? ?
?? ISIF?? = 0?????????????
?? ISPIN? = 2???????????????????
-------------------------------------------
Ionic Relaxation:
-------------------------------------------
?? EDIFFG =-0.03????????????
?? NSW??? = 5000????????????
?? IBRION = 0
--------------------------------------------
DOS Related:
--------------------------------------------
?? ISMEAR = 1
?? SIGMA? = 0.2
? ?LORBIT =11
--------------------------------------------??
Output Control:???????????????????????????????
--------------------------------------------??
?? LWAVE? = .FALSE.
?? LCHARG = .FALSE.
--------------------------------------------
NBLOCK = 1
KBLOCK = 50
TEBEG=300 ?
TEEND=300 ?
NWRITE = 0
MAXMIX = 40
SMASS = 3

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1楼2018-04-05 11:41:47
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only_大师

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
15楼: Originally posted by lyli2017 at 2018-04-06 17:06:01
问号请忽略哈
...

potim咋设置这么大。。。一般初次优化结构都是0.5，精优可能是0.1充分优化不应该是isif=3么？你们是自己的单个服务器还是服务器群？是几个节点几个核？npar的设置跟这个有关系。另外如果体系原子很多，根据经验kpoints建议设小点，大了不一定就更好

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lyli2017 lyli2017 lyli2017 lyli2017
16楼2018-04-07 08:51:28
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普通回帖

lyli2017

新虫 (小有名气)
问号请忽略，貌似复制过来乱码了～

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2楼2018-04-05 11:42:22
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lyli2017

新虫 (小有名气)
INCAR用别人写的其他也是一样的问题:小体系能用，大体系算一步自动掉。

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3楼2018-04-05 11:45:38
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lyli2017

新虫 (小有名气)


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4楼2018-04-05 11:48:26
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guazifeng

至尊木虫 (著名写手)
用的vasp5.3？

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5楼2018-04-05 13:04:38
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guazifeng

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
lyli2017: 金币+10, 请问怎么减少核呢？INCAR里设置？ 2018-04-05 14:26:29
应该是内存不够吧，少用一些核跑

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lyli2017
6楼2018-04-05 13:05:15
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lyli2017

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by guazifeng at 2018-04-05 13:05:15
应该是内存不够吧，少用一些核跑

是的，5.3，请问怎么减少核？在INCAR里设置嘛？

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7楼2018-04-05 14:27:31
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匿名

用户注销 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lyli2017: 金币+10, 请问需要老师的root权限？还是自己在bin里？vtst里面改呢？自己能改的话，请告知大概位置，我自己折腾折腾。。 2018-04-05 17:44:13
本帖仅楼主可见

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lyli2017
8楼2018-04-05 17:04:08
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lyli2017

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by 青夙阳梦 at 2018-04-05 17:04:08
在脚本文件里
...

请问需要老师的root权限？还是自己在bin里？vtst里面改呢？自己能改的话，请告知大概位置，我自己折腾折腾。。

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9楼2018-04-05 17:45:04
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lyli2017

新虫 (小有名气)
求问，除了内存还有其它的问题嘛？谢谢大家了～

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10楼2018-04-05 22:35:06
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