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lyli2017

新虫 (小有名气)

[交流] VASP跑分子动力学,小体系能跑,大体系作业会掉,求大腿帮忙~~

KPOINTS用gamma或者不是gamma都一样。
INCAR一样的,就只能在2x2的表面跑,4x4的作业跑一步自动掉。求问解决方案,谢谢了~
体系是有机小分子覆盖在金属表面。
寻求能量最低点,想试试。
作业说killed by signal 9
请问是内存问题还是?请问怎么解决呢?
GGA = PE?????????????????? ?
?? POTIM = 2???????????????? ?????????????????
?? NPAR?? = 1
?? LPLANE = .TRUE.
------------------------------------------
Electronic Relaxation:
-----------------------------------------
?? LREAL? = Auto???????????? ?????????????????????
?? ENCUT? = 400
?? PREC?? = Normal????
?? EDIFF? = 1e-5?????????????
?? IALGO? = 48????????????
?? NELM=? 70?????????????????
?? NELMIN = 4???????????????? ?
?? ISIF?? = 0?????????????
?? ISPIN? = 2???????????????????
-------------------------------------------
Ionic Relaxation:
-------------------------------------------
?? EDIFFG =-0.03????????????
?? NSW??? = 5000????????????
?? IBRION = 0
--------------------------------------------
DOS Related:
--------------------------------------------
?? ISMEAR = 1
?? SIGMA? = 0.2
? ?LORBIT =11
--------------------------------------------??
Output Control:???????????????????????????????
--------------------------------------------??
?? LWAVE? = .FALSE.
?? LCHARG = .FALSE.
--------------------------------------------
NBLOCK = 1
KBLOCK = 50
TEBEG=300 ?
TEEND=300 ?
NWRITE = 0
MAXMIX = 40
SMASS = 3

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only_大师

新虫 (小有名气)

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
lyli2017: 金币+10, 谢谢~我去试试,请问INCAR里怎么改,可以有同等效果呢? 2018-04-06 11:33:11
一般就是内存不够,要么把核数调小,要么节点调多,要么kpoints调小

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11楼2018-04-06 09:13:34
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only_大师

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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12楼: Originally posted by lyli2017 at 2018-04-06 11:33:27
谢谢~我去试试,请问INCAR里怎么改,可以有同等效果呢?
...

这得看你机器的配置,你可以把incar贴出来看看

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13楼2018-04-06 16:05:49
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only_大师

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15楼: Originally posted by lyli2017 at 2018-04-06 17:06:01
问号请忽略哈
...

potim咋设置这么大。。。一般初次优化结构都是0.5,精优可能是0.1充分优化不应该是isif=3么?你们是自己的单个服务器还是服务器群?是几个节点几个核?npar的设置跟这个有关系。另外如果体系原子很多,根据经验kpoints建议设小点,大了不一定就更好

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16楼2018-04-07 08:51:28
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only_大师

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20楼: Originally posted by lyli2017 at 2018-04-07 11:53:59
一个节点,16个核。换两个节点也不行。。   gg,KPOINTS和INCAR改过很多种。。。貌似回复了很多条信息。。打扰了
...

16个核你就别想了。。。果断kpoints调小,别的都不好使

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21楼2018-04-07 23:01:47
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only_大师

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22楼: Originally posted by lyli2017 at 2018-04-07 23:08:25
不对。。貌似是一个核,16个节点。。
...

大兄弟,手机都不止一个核。。一个是节点,16个是核。别想了,16个核算200个原子以上的就会吃力了,kpoints最好跟你的超胞结构匹配,比如你的超胞是2×2×1,你的k点也最好设成这个,不然很容易停

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23楼2018-04-08 00:51:52
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