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大笨笨熊

新虫 (小有名气)

[交流] gro

谁会把多个gro拼接在一起吗？

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1楼 2018-04-01 21:42:09
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gengxin60
2楼2018-04-01 22:14:58
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gromacs命令好好读一读

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3楼2018-04-01 23:15:29
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大笨笨熊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2018-04-01 23:15:29
gromacs命令好好读一读

我应该说详细一点的，我是想把一个gro的构型放到另一个gro的指定位置，坐标要怎么处理就不重合了，不是单纯的cat在一起，谢谢回答

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4楼2018-04-02 09:32:59
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 大笨笨熊 at 2018-04-02 09:32:59
我应该说详细一点的，我是想把一个gro的构型放到另一个gro的指定位置，坐标要怎么处理就不重合了，不是单纯的cat在一起，谢谢回答
...

这个很简单，先把两个GRO文件合并成一个，再都导入到VMD里面，把你需要的结构移动到指定位置保存，输出即可。
vmd  的moveby 命令会帮你实现移动。
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5楼2018-04-02 12:14:42
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大笨笨熊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gengxin60 at 2018-04-01 22:14:58



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6楼2018-04-02 13:14:55
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大笨笨熊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2018-04-02 12:14:42
这个很简单，先把两个GRO文件合并成一个，再都导入到VMD里面，把你需要的结构移动到指定位置保存，输出即可。
vmd  的moveby 命令会帮你实现移动。...

谢谢，那么他的itp怎么处理，手动写吗，还是能生成？

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7楼2018-04-02 16:28:40
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