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【求助】如何正确输入BSSE文件
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| 我的体系含有Ru, O , H ,C 原子，采用B3LYP/GENECP 基组 请问如何输入正确的 计算相互作用的文件 谢谢大家的帮助 |
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4楼2009-03-17 11:04:19
yuhuobuku
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bents(金币+1):谢谢参与
bents(金币+5,VIP+0):如果使用ONIOM方法 请问是不是也可以呢？ 3-17 10:53
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 3-18 08:57
bents(金币+1):谢谢参与
bents(金币+5,VIP+0):如果使用ONIOM方法 请问是不是也可以呢？ 3-17 10:53
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 3-18 08:57
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用counterpoise关键字： #uB3LYP/6-31G Counterpoise=2 SCF=(tight) C2 + NO --> C2NO 0 2 0 1 0 2 C 0.000000 1.600184 0.000000 1 C 0.000000 0.960265 0.000000 1 N 0.208401 3.031919 0.000000 2 O 1.164068 3.666273 0.000000 2 0 2 0 1 0 2分别代表总体系电荷和多重度，片段一的电荷和多重度，片段二的电荷和多重度。 分子坐标后的1和2是定义的片段 用Bq原子： # b3lyp/3-21G** nosymm scf=tight test HBr + H2O manual counterpoise calculation, H2O removed 0 1 H 0.685176 -0.004924 -0.026973 Br -0.771917 0.000050 0.001967 O-Bq 2.536864 -0.000136 -0.051401 H-Bq 3.015128 0.789231 0.184042 H-Bq 3.021888 -0.784986 0.185282 这就相当于用HBr + H2O的基组计算HBr 举个例子，比如计算AB体系的BSSE矫正： 需要得出的五个能量分别是： 第一个是整体的能量E(AB) 第二个是单独计算A的能量E(A) 第三个是单独计算B的能量E(B) 第四个是计算在AB基组下，A的能量E(A/AB) 第五个是计算在AB基组下，B的能量E(B/AB) 那么，BSSE energy =E(A)+E(B)-E(A/AB)-E(B/AB)。计算E(A/AB)的基函数是计算AB的基函数，而计算E(A)的基函数只是计算AB基函数的一部分，基函数越多，能量计算的越准确，能量计算越准确，就越低，所以E(A/AB) 输出文件里面5个scf第一个是整体的能量(记为E(AB))，后面4个是单体能量，分别是2个部分在整体基组和各自基组下的能量。 我当时是用-Bq原子算的BSSE矫正， 估计你是用CP方法吧。但原理都是一样的。 |
2楼2009-03-17 09:58:02
yuhuobuku
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3楼2009-03-17 09:59:34
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我试验了一下 但是输出的提示如下 %chk=AA4_bsse.chk %mem=1700mb %nproc=4 Will use up to 4 processors via shared memory. ----------------------------------------------------------------- # oniom(b3lyp/genecp:b3lyp/3-21g) nosymm scf=tight Counterpoise=2 ----------------------------------------------------------------- Cannot combine ONIOM and Counterpoise. 请问 为什么？ |
5楼2009-03-17 11:27:30