24小时热门版块排行榜    

查看: 1373  |  回复: 13

poseidon008

新虫 (小有名气)

[求助] 十万火急!reviewer的问题不知如何回答 已有2人参与

我是用16s rRNA 高通量测序检测微生物群落的变化,我们做高通量的结果通常都是用相对丰度的变化来表示某个属的变化,但是reviewer的意思是去掉这部分内容,这样文章就少了一些内容,不知道怎么解决才好,求高人指点
The relative abundance of the bacterial phyla and classes are not independent and cannot be compared directly with univariate statistics. Each of the phyla or classes are interrelated in a sample. I know that these types of comparisons have been completed in the past (in several papers) but we need to do it correctly. I suggest omitting this kind of statistics in the text。
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

snmrna

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
做一下不同门的相关性分析,用确认了无相关性的数据来分析试试

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2018-03-27 23:45:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

审稿人意思可能是,每个种属不能单独进行比较,必须把样品中所有属数据拼接后进行比较,因为每个种的相对丰度是由其他种数量决定的

发自小木虫Android客户端
4楼2018-03-28 07:11:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

你可以做个拼接的柱状图,不就OK了么,不同纹理或者颜色表示

发自小木虫Android客户端
5楼2018-03-28 07:12:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snmrna

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by poseidon008 at 2018-03-28 15:06:27
怎么做呢...

R语言可以做,你查一下

发自小木虫IOS客户端
9楼2018-03-28 18:52:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snmrna

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by poseidon008 at 2018-03-29 09:08:20
有这样做过的文献可以推荐下吗...

我也是最近看R语言的资料发现它的这方面的应用。你看看这篇文章是不是讲了,https://www.nature.com/articles/ismej2009112,我随手搜的,还没看全文
11楼2018-03-29 10:43:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sdxlwxs

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


小冀-: 金币+1, 应助指数+1, 鼓励回帖交流 2018-04-17 12:27:06
看审稿人的意思是针对你的统计方式的,认为不应该通过单因素统计直接比较门或者纲的数据。审稿人的建议应该只是让你去掉统计方面的数据,对具体丰度的数据应该不用删除。

看审稿人的意见还是挺强硬的,建议按他的意见来。如果你和审稿人argue的话,有可能被拒哦。

不过以前的文章确实有很多都是单独比较某一个门在不同样品中的丰度。
13楼2018-04-17 11:15:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

在水壹方

新虫 (小有名气)

2楼2018-03-25 23:46:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

或者热图也可以

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2018-03-28 07:30:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

poseidon008

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by snmrna at 2018-03-27 23:45:40
做一下不同门的相关性分析,用确认了无相关性的数据来分析试试

怎么做呢
7楼2018-03-28 15:06:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

poseidon008

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by snoopytbw at 2018-03-28 07:30:49
或者热图也可以

图已经做了,不过还需要统计数据
8楼2018-03-28 15:08:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

poseidon008

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by snmrna at 2018-03-28 18:52:58
R语言可以做,你查一下
...

有这样做过的文献可以推荐下吗
10楼2018-03-29 09:08:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 poseidon008 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
[考研] 085602 289分求调剂 +4 WWW西西弗斯 2026-03-24 4/200 2026-03-24 16:13 by 星空星月
[考研] 321求调剂 +4 Ymlll 2026-03-24 4/200 2026-03-24 14:44 by sprinining
[考研] 085600材料与化工调剂 +7 A-哆啦Z梦 2026-03-23 12/600 2026-03-23 23:16 by 星空星月
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +7 生物工程调剂 2026-03-17 12/600 2026-03-23 18:18 by YMU施老师
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 考研调剂 +4 来好运来来来 2026-03-21 4/200 2026-03-22 12:15 by 星空星月
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
信息提示
请填处理意见