| 查看: 2112 | 回复: 6 | |||
[交流]
amber创建拓扑报错及找不到pdb4amber命令
|
|
使用amber12+ambertools13的组合，由pdb文件创建拓扑文件时，会遇到“the file contained 575 atoms not in residue temples”以及“FATAL: Atom .R<NASP 1> A. <HB1 15> does not have a type”的错误，应该如何解决？是否需要reduce和pdb4amber两个命令先处理pdb文件后再生成拓扑文件？但是我的tleap下找不到pdb4amber命令是为什么？非常感谢大神！ 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
zmnhztt» 猜你喜欢
研究生做的很差，你们会让毕业吗？
已经有9人回复
-
求碳排放博导；方向是LCA、生命周期可持续发展以及碳排放
已经有7人回复
-
2026博士申请求助
已经有4人回复
-
2026博士或科研助理转27年博士
已经有7人回复
-
急招2026年9月份入学博士
已经有3人回复
-
26申博
已经有3人回复
-
申博自荐
已经有7人回复
-
26年博士申请自荐-电催化
已经有7人回复
-
2026年博士申请求捞
已经有3人回复
-
国自科送审了吗
已经有11人回复
沙漠猎人
版主 (正式写手)
- 应助: 33 (小学生)
- 贵宾: 0.003
- 金币: 5468.4
- 散金: 101
- 红花: 12
- 帖子: 433
- 在线: 92.6小时
- 虫号: 2524679
- 注册: 2013-06-28
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
- 管辖: 分子模拟
2楼2018-03-19 13:00:44
3楼2018-03-19 19:41:34
沙漠猎人
版主 (正式写手)
- 应助: 33 (小学生)
- 贵宾: 0.003
- 金币: 5468.4
- 散金: 101
- 红花: 12
- 帖子: 433
- 在线: 92.6小时
- 虫号: 2524679
- 注册: 2013-06-28
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
- 管辖: 分子模拟
4楼2018-03-19 20:04:06
5楼2019-01-09 15:08:50
6楼2019-01-09 15:11:22
7楼2019-10-21 18:47:34