应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 对接参数设置
51/1返回列表
查看: 1714  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

my_destiny

金虫 (小有名气)

[求助] 对接参数设置 已有1人参与

请教各位大神，在做分子对接前，对接参数应该怎么调节才能使同批阳性化合物的活性值与其打分值相对应？如果反复调节无明显改善，应该怎么办？
谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2018-03-17 19:22:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风中追风8

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hclwonder at 2018-03-27 13:05:54
其实多数对接打分就是根据结合能，当然是粗略的。
要算较准确的结合能也是有软件的，但计算量比较大，没有高配置的话，算一个可能就需要比较长时间。
目前最准的可能是schrodinger软件的FEP＋模块，但软件超贵，也 ...

嗯嗯，我就在使用薛定谔，不过计算的时间倒不是需要多长。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2018-03-27 15:40:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

沙漠猎人

版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
my_destiny: 金币+1, ★有帮助, 有帮助，可以更详细些 2018-03-18 12:36:23
不能只看对接的打分值，那个东西只能作为参考，要看具体的结合构象
赞一下 回复此楼
www.modekeji.cn
2楼2018-03-17 20:29:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风中追风8

新虫 (初入文坛)
用的什么软件呢？打分值不是评判的唯一标准，软件能不能提供结合能之类的信息呢？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2018-03-27 13:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 风中追风8 at 2018-03-27 13:00:35
用的什么软件呢？打分值不是评判的唯一标准，软件能不能提供结合能之类的信息呢？

其实多数对接打分就是根据结合能，当然是粗略的。
要算较准确的结合能也是有软件的，但计算量比较大，没有高配置的话，算一个可能就需要比较长时间。
目前最准的可能是schrodinger软件的FEP＋模块，但软件超贵，也需要有相应的计算资源。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2018-03-27 13:05:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 5+4 想要一壶桃花水 2026-03-25 10/500 2026-03-26 19:56 by 不吃魚的貓
[考研] 0703化学338求调剂！ +4 Zuhui0306 2026-03-26 4/200 2026-03-26 19:07 by macy2011
[考研] 材料考研求调剂 +3 Dendel 2026-03-23 6/300 2026-03-26 17:51 by fmesaito
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +5 kongweilin 2026-03-26 7/350 2026-03-26 14:37 by mapenggao
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 环境专硕324分求调剂推荐 +5 轩小宁—— 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:05 by i_cooler
[考研] 材料与化工328分调剂 +6 。，。，。，。i 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:30 by 418490947
[考研] 308求调剂 +5 墨墨漠 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:19 by 544594351
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +7 niko- 2026-03-22 7/350 2026-03-25 20:14 by qingfeng258
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 344求调剂 +3 desto 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:09 by 搏击518
[考研] 材料/农业专业，07/08开头均可，过线就行 +3 呵唔哦豁 2026-03-23 4/200 2026-03-23 22:30 by 汪！？！
[考研] 298求调剂 +8 上岸6666@ 2026-03-20 8/400 2026-03-23 11:02 by laoshidan
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 315分，诚求调剂，材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 求调剂一志愿海大，0703化学学硕304分，有大创项目，四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭