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jiaozihao

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[求助] ms 分子动力学统计性质时选用什么系综呢？已有1人参与

大家好！
   在用ms forcite模块做分子动力学模拟时，先选用了相关系综使系统已经达到了所需要的平衡态，然后在统计系统性质比如算自扩散系数、径向分布函数时，还需要另外选择系综作统计吗？这是依据什么来进行选择的呢？
   谢谢大家！！！！
   求助~~~~！！！！

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1楼 2018-03-17 09:55:24

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

brucefan

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【答案】应助回帖

引用回帖:

3楼: Originally posted by jiaozihao at 2018-03-17 19:50:05
谢谢您的回复！我可否再请教一下为什输运系数不能用随机系综呢？这种系综选取有什么要求吗？
麻烦您啦！！

随机系综会扰动系统的动力学。如果系统已经达到平衡，一般用NVE系综算输运系数。如果是要算能量涨落之类（例如在计算热容时），那就必须用NVT或者NPT，而且对实现这些系综的算法要求还很高。例如Berendsen在此种情况下就不合适，而Nose Hoover（chain）就好些。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]