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jiaozihao

新虫 (小有名气)

[求助] ms 分子动力学统计性质时选用什么系综呢? 已有1人参与

大家好!
      在用ms forcite模块做分子动力学模拟时,先选用了相关系综使系统已经达到了所需要的平衡态,然后在统计系统性质比如算自扩散系数、径向分布函数时,还需要另外选择系综作统计吗?这是依据什么来进行选择的呢?
     谢谢大家!!!!
     求助~~~~!!!!
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaozihao at 2018-03-17 19:50:05
谢谢您的回复!我可否再请教一下为什输运系数不能用随机系综呢?这种系综选取有什么要求吗?
麻烦您啦!!

随机系综会扰动系统的动力学。如果系统已经达到平衡,一般用NVE系综算输运系数。如果是要算能量涨落之类(例如在计算热容时),那就必须用NVT或者NPT,而且对实现这些系综的算法要求还很高。例如Berendsen在此种情况下就不合适,而Nose Hoover(chain)就好些。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

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4楼2018-03-17 20:11:00
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你算的这两个性质对系综都不敏感。可以用决定性的NVT,也可以用NVE。算输运系数不能用随机系综,例如由Langevin热浴实现的NVT系综。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2018-03-17 15:05:35
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jiaozihao

新虫 (小有名气)

谢谢您的回复!我可否再请教一下为什输运系数不能用随机系综呢?这种系综选取有什么要求吗?
麻烦您啦!!
3楼2018-03-17 19:50:05
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jiaozihao

新虫 (小有名气)

5楼2018-03-17 21:35:37
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