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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 求助求助，需要大佬帮忙
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小黄花

新虫 (正式写手)

[求助] 求助求助，需要大佬帮忙

本科毕业课题做的是计算机虚拟筛选嘛，用的是DS跟autodock，然而面对这两个软件就很懵，现在的情况是中药小分子都找好了，蛋白质分子也下好了，就是不知道怎么筛选跟对接，有没有大佬稍微闲一点的或者是好心的，咱加个好友，教教我怎么弄！小女感激不尽！

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1楼 2018-03-15 16:52:52
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小黄花

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 柏杨汀芷 at 2018-03-18 00:55:27
哎心痛，已经到了整理数据的时候，数据库太大了的，头都要爆了，发现了错误也不晓得在哪里，要找好久

是小分子的数据库太大了吗

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5楼2018-03-18 08:19:37
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emphasis夕

新虫 (初入文坛)
我也刚接触，有问题，可以互相交流，下载的蛋白PDBID里有自身 native ligands，那个点基本就是加球的地方

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2楼2018-03-16 10:35:19
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小黄花

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by emphasis夕 at 2018-03-16 10:35:19
我也刚接触，有问题，可以互相交流，下载的蛋白PDBID里有自身 native ligands，那个点基本就是加球的地方

加个联系方式吧，互相交流

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3楼2018-03-16 13:00:29
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柏杨汀芷

新虫 (初入文坛)
哎心痛，已经到了整理数据的时候，数据库太大了的，头都要爆了，发现了错误也不晓得在哪里，要找好久

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4楼2018-03-18 00:55:27
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秦璇璇

新虫 (初入文坛)
求问，小分子是从chemdraw作图，然后转格式在autodock中运行么？

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6楼2018-03-29 22:03:52
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303134286

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 柏杨汀芷 at 2018-03-18 00:55:27
哎心痛，已经到了整理数据的时候，数据库太大了的，头都要爆了，发现了错误也不晓得在哪里，要找好久

可以用脚本处理呀，比如perl

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7楼2018-03-29 22:55:05
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柏杨汀芷

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 303134286 at 2018-03-29 22:55:05
可以用脚本处理呀，比如perl
...

计算机学的不行，都是手动查错

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8楼2018-04-08 13:21:41
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我要去抓妖怪

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
1楼: Originally posted by 小黄花 at 2018-03-15 16:52:52
本科毕业课题做的是计算机虚拟筛选嘛，用的是DS跟autodock，然而面对这两个软件就很懵，现在的情况是中药小分子都找好了，蛋白质分子也下好了，就是不知道怎么筛选跟对接，有没有大佬稍微闲一点的或者是好心的，咱加 ...

您好，您现在会用autodock了吗 我最近刚开始学 有些问题想请教

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9楼2018-05-25 12:27:47
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小黄花

新虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 我要去抓妖怪 at 2018-05-25 12:27:47
您好，您现在会用autodock了吗 我最近刚开始学 有些问题想请教
...

会些了

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10楼2018-05-26 09:25:15
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