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MS中如何用分子动力学模拟高分子聚合物溶液模型的粘度 已有1人参与
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在MS的Amorphous Cell构建了高分子聚合物溶液的模型，并用分子动力学进行了平衡，再用Forcite的Shear模块做了剪切，发现该模块计算出的粘度和实际偏离很大，很多时候算出的均值还是负值。 后来用压力自相关函数对上述Shear模块得到的轨迹文件做了统计，算出的剪切粘度总算是正的了，但是发现计算出的粘度和统计的时间有很大关系，统计的时间每大一个数量级，粘度也跟着大一个数量级，这个统计的时间应该如何确定?（有人说好像是要根据松弛时间确定） 可能我计算粘度的方法可能也有些问题，望各路大神不吝赐教，感激不尽。 |
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这个是动态MD算粘度时用到的L-E边界条件文献。 |
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