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juliusluan78

木虫 (著名写手)

[交流] 求助:CTAB法提取真菌标本DNA

我用CTAB法提取担子菌子实体标本DNA,采用的是以下实验步骤:
(1)取材:取2~4 mg干净的菌块干标本或碎片在1.5 ml于微量离心管中,将该离心管及无菌的研钵、微型研柞于-20℃冰箱预冷。
(2)液氮研磨:将液氮倒入预冷的研钵中,该预冷的微量离心管置于其中,用微型研柞直接在微量离心管中将干标本研磨成细粉。
(3)CTAB提取:在微量离心管中加入65 ℃水浴保温的2%( w/v)CTAB抽提缓冲液700 µl在旋涡混合器上震荡数秒,使之充分混合均匀后,于65 ℃水浴温育0.5-2小时。
(4)酚:氯仿:异戊醇抽提:冷却至室温后,加入与之等体积的饱和酚:氯仿:异戊醇(25:24:1) ,颠倒混匀10分钟;13000 rpm离心15分钟,用200 µ1移液器将上清液转入新的离心管中,弃沉淀。
(5)氯仿:异戊醇抽提:上清液中加入与之等体积的氯仿:异戊醇(24: 1),颠倒混匀10分钟;13000 rpm离心15分钟,用200 µ1的微量移液器将含有DNA的上层(水相)小心地移入一只新管中,如果在水相和有机相交界处有白色 沉淀物,则重新抽提有机相1-2次,合并水相。将最终的上清液用 200 µ1的微量移液器小心转入一只新离心管中。
(6)乙酸钠调节:往上清液(DNA溶液)中加入1/10体积的3 mol/L pH5.2的乙酸钠, 用手指轻弹离心管壁几次使之混匀。
(7)异丙醇沉淀:加入与DNA溶液(含盐溶液)等体积的异丙醇(-4 ℃预冷)轻轻混匀,于-4℃静置过夜。
(8)75%乙醇洗涤:13000 rpm离心15分钟,弃上清液,用75%乙醇洗涤沉淀物两次。
(9)干燥:室温下自然晾干。
(10)DNA的重悬:自然干燥后加入20 µ1无菌的超纯水重悬。
(11)取2~5 µl DNA于1 %琼脂糖凝胶电泳检测DNA的质量和浓度。
采用以上方法提取物检测照片见附件(最亮的那一团的条带,箭头标注)
后面我又采用将装有菌块的离心管置于液氮(5min),取出用微研杵研磨,反复3次,再按照以上方法提取,结果离心后发现什么也没有,甚至连对照新鲜的菌丝也没有提出来
那位楼主能救救急,万分感激!
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坚持就是胜利
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欣晴5832

金虫 (小有名气)

你为什么没有放marker,这个基因组DNA的分子量大概是多少
2楼2009-03-13 13:21:29
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沙谷幽兰

木虫 (小有名气)


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢提供帮助,欢迎常来~ 3-14 20:16
菌丝体研磨不用加液氮吧,我们实验室提植物叶片DNA才要加液氮,我想你试验失败的原因是不是因为用的试剂的问题,不同厂家生产的试剂有可能会导致试验结果的不同,我们实验室也有好几个人做这方面的,有时也会做不出结果,你可以每步仔细看看,排查下有哪些地方出问题
3楼2009-03-13 13:35:28
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梧桐眼

金虫 (著名写手)

楼上的大哥!真菌研磨不用加液氮吗?先说明我不太懂,可是很多资料上都使用液氮的啊 !大哥给我讲讲啊 !
4楼2009-03-14 20:15:12
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