应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】优化构型
61/1返回列表
查看: 563  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

effi903

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化构型

DMol优化完以后的文件夹下面的*.xsd是不是就是最后优化完的结构（更新过的）？我发现这个结构与hist.xsd轨迹文件中的最后一步构型不一样，坐标有差别，差别不大。这是我计算的问题呢，还是DMol就是这样？如果就是这样的话，我最后的结构应该用哪一个呢？是轨迹文件的最后一步还是*.xsd？请高手指教！

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 21:18 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-03-11 16:27:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglianli136

铁杆木虫 (著名写手)
★
spur(金币+1,VIP+0): 3Q！！谢谢帮助！ 3-11 16:57
轨迹文件是可以运动的，你播放到最后一步停止，最终状态就和你的xsd文件一样了
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2009-03-11 16:39:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

effi903

铜虫 (小有名气)
我的就是轨迹文件的最后一步和xsd文件不一样啊。
赞一下 回复此楼
3楼2009-03-11 16:48:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglianli136

铁杆木虫 (著名写手)
★
wuchenwf(金币+1):谢谢 O(∩_∩)O
有时候你的运动是倒着的！
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-03-11 20:29:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

effi903

铜虫 (小有名气)
有个师姐用的也是DMol，也有我这个情况，难道其他人的轨迹文件的最后一步和xsd文件是一样的？从图上看没有什么区别，但是输出坐标看一下就有区别了。还有哦哦的运动不是倒着的。
赞一下 回复此楼
5楼2009-03-11 20:45:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
wuchenwf(金币+2):谢谢 O(∩_∩)O
effi903(金币+2,VIP+0):谢谢 3-13 14:07
一般在计算结束后，软件会自动更新xsd文件。但为了确保正确，在几何优化或动力学之后最好还是这么做一下：打开xsd文件后，analyse->structure->update
这个updata是根据结果文件中的最终坐标值的进行，所以肯定是正确的
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2009-03-12 09:21:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 effi903 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 17:23 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 17:15 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +7 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 7/350 2026-09-15 16:23 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 3/150 2026-09-15 15:27 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:50 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:49 by VMDqgnlKimtZ
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 14:38 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:22 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:14 by VMDqgnlKimtZ
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:58 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:14 by C79jjtjAKjEn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 08:02 by C79jjtjAKjEn
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:34 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:50 by 5BDX0d0WFp7t
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-15 06:38 by 5BDX0d0WFp7t
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 21:37 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:25 by vZfe6xYu34yj
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +4 两三岁ss 2026-09-14 4/200 2026-09-14 20:29 by 班主任的同桌
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭