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wenbin2012

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 一个晶体中有两个相同的不对称单元的结构,如何将其转化成只有一个不对称单元的结构 已有2人参与

有一个晶体数据,投稿时,晶胞是13.339 14.176 15.387 108.73 90.04 105.24 V=2647,晶体中有两个相同的不对称单元,而审稿人要求用另外一个晶胞去解:9.694 11.992 12.812 110.38 94.93 104.92 V=1323,晶体应该是只有一个不对称单元(系列同构的稀土化合物)。请各位大神指点如何操作,才能转化晶胞。谢谢!
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用platon升一下空间群就好了,如果不行的话,就重新还原数据
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
2楼2018-03-03 12:26:42
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
升空间群试试,如果不行的话很可能是这两个不对称单元对称性有所不同,那就可能要重新培养单晶收集数据了
3楼2018-03-03 13:24:38
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wenbin2012

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2018-03-03 12:26:42
用platon升一下空间群就好了,如果不行的话,就重新还原数据

platon升不动。
4楼2018-03-04 20:30:12
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wenbin2012

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by DJ_Tokyo at 2018-03-03 13:24:38
升空间群试试,如果不行的话很可能是这两个不对称单元对称性有所不同,那就可能要重新培养单晶收集数据了

空间群没变,platon升不动。
5楼2018-03-04 20:31:12
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wenbin2012

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by DJ_Tokyo at 2018-03-03 13:24:38
升空间群试试,如果不行的话很可能是这两个不对称单元对称性有所不同,那就可能要重新培养单晶收集数据了

审稿人的意见:
3.1 There has been a problem with the correct determination of the unit-cell data for this complex. Routine checks show that the reported triclinic cell data with Z = 2 can be transformed to a new smaller triclinic cell which is now really isomorphous with that reported for compound 2, with Z = 1.

T.R.A.N.S.F.O.R.M.A.T.I.O.N M.A.T.R.I.X for CELL and HKL DATA
=============================================================
Reduced->Convent Input->Reduced T = Input->Convent: a' = T a
--------------------------------------------------------------------------------
( 1 0 0 ) ( -1/2 -1/2 -1/2 ) ( -1/2 -1/2 -1/2 ) Det(T)
( 0 1 0 ) X ( -1/2 1/2 1/2 ) = ( -1/2 1/2 1/2 ) =
( 0 0 1 ) ( 1/2 1/2 -1/2 ) ( 1/2 1/2 -1/2 ) 0.500

Cell Lattice a b c Alpha Beta Gamma Volume CrystalSystem Laue
--------------------------------------------------------------------------------
Input aP 13.339 14.176 15.387 108.73 90.04 105.24 2647 triclinic -1
aP 9.694 11.992 12.812 110.38 94.93 104.92 1323 Triclinic -1
6楼2018-03-04 20:34:48
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wenbin2012

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2018-03-03 12:26:42
用platon升一下空间群就好了,如果不行的话,就重新还原数据

审稿人的意见:
3.1 There has been a problem with the correct determination of the unit-cell data for this complex. Routine checks show that the reported triclinic cell data with Z = 2 can be transformed to a new smaller triclinic cell which is now really isomorphous with that reported for compound 2, with Z = 1.

T.R.A.N.S.F.O.R.M.A.T.I.O.N M.A.T.R.I.X for CELL and HKL DATA
=============================================================
Reduced->Convent Input->Reduced T = Input->Convent: a' = T a
--------------------------------------------------------------------------------
( 1 0 0 ) ( -1/2 -1/2 -1/2 ) ( -1/2 -1/2 -1/2 ) Det(T)
( 0 1 0 ) X ( -1/2 1/2 1/2 ) = ( -1/2 1/2 1/2 ) =
( 0 0 1 ) ( 1/2 1/2 -1/2 ) ( 1/2 1/2 -1/2 ) 0.500

Cell Lattice a b c Alpha Beta Gamma Volume CrystalSystem Laue
--------------------------------------------------------------------------------
Input aP 13.339 14.176 15.387 108.73 90.04 105.24 2647 triclinic -1
aP 9.694 11.992 12.812 110.38 94.93 104.92 1323 Triclinic -1
7楼2018-03-04 20:35:59
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wenbin2012

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by DJ_Tokyo at 2018-03-03 13:24:38
升空间群试试,如果不行的话很可能是这两个不对称单元对称性有所不同,那就可能要重新培养单晶收集数据了

按照审稿人的意见,是可以转的,但是我没看明白审稿人的提出的矩阵是怎么样的?没法输入。
8楼2018-03-04 20:39:11
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wenbin2012

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2018-03-03 12:26:42
用platon升一下空间群就好了,如果不行的话,就重新还原数据

按照审稿人的意见,是可以转的,但是我没看明白审稿人的提出的矩阵是怎么样的?没法输入。
9楼2018-03-04 20:39:17
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wenbin2012 at 2018-03-04 20:39:17
按照审稿人的意见,是可以转的,但是我没看明白审稿人的提出的矩阵是怎么样的?没法输入。...

你把数据发上来看看

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以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
10楼2018-03-04 22:27:55
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