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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 新型体外诊断技术-Sherlock技术 已有2人参与

Sherlock技术的原理实际上主要是利用Cas13a蛋白(又叫做C2C2)的一种叫做“collateral effect”的效应,简单说来就是,当Cas13a和crRNA结合,并识别相应的RNA序列之后,就激活了Cas13a的RNA酶活性,能够切割其他所遇到的任何RNA,这就是所谓的‘collateral effect’。此时,这个酶就会剪切一个荧光报告基团(quenched fluorescent RNA,实际上是一种高灵敏的检测RNA酶活性的试剂,正常情况下不发光,一旦被RNA酶剪断,就会发光,然后只需要检测到荧光就能够判断是否具有RNA酶活性了),然后发光,其后就可以被检测了。

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▲Sherlock技术原理

Sherlock技术中最重要的蛋白质,Cas13a的发现历程是怎样的呢?

实际上,最早在2015年,张锋实验室通过比对class2型的蛋白序列,发现Cas13a与种不同,其不具有Ruvc结构域,即没有DNA酶活性,但是具有两个HEPN结构域,众所周知,HEPN结构域具有RNA酶活性,因此,推测Cas13a具有RNA酶活性。

而他们进一步在2016年4月就在《科学》杂志上面报道了Cas13a是一个RNA介导的RNA酶。

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▲张锋团队2016年4月就在《科学》杂志上面报道了Cas13a是一个RNA介导的RNA酶

然而,戏剧性的是,竞争对手杜德拉教授则是在短短几个月之后,就在《Nature》上面发表相关文章。杜德拉实验室更进一步,证明Cas13a具有两种RNA酶活性,一种是切割pre-crRNA称为成熟crRNA酶活性,一种是HEPN结构域的RNA酶活性。

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▲杜德拉教授团队则是在短短几个月之后,就在《Nature》上面发表相关文章,第一次将Cas13a应用于基因检测,然而灵敏度太低

当Cas13a和crRNA结合,并识别相应的RNA序列之后,就激活了Cas13a的RNA酶活性,能够切割其他RNA,这就是所谓的‘collateral effect’。因此,他们首次将Cas13a应用于检测RNA,也采用的猝灭荧光的RNA作为报告基团的。然而,当时杜德拉实验室的检测灵敏度仅能够达到nM级别,没有实际应用价值。所以说,单纯使用Cas13a检测灵敏度太低,无使用价值。


http://mp.weixin.qq.com/s/sI24xdNLqC9_5MtrtcfZEw

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小虫草菌

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
广州博徕斯生物科技股份有限公司,是国内首家拥有基因编辑(cas系列)蛋白种类最全厂家,也有在做cas12a和cas13a蛋白,可以找一下这个公司了解一下。
3楼2019-03-04 11:31:06
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棍子168

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有公司已经在做这方面的专利准备了

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天道酬勤
2楼2018-02-20 21:00:16
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