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snoopytbw荣誉版主 (著名写手)
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新型体外诊断技术-Sherlock技术已有2人参与
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Sherlock技术的原理实际上主要是利用Cas13a蛋白(又叫做C2C2)的一种叫做“collateral effect”的效应,简单说来就是,当Cas13a和crRNA结合,并识别相应的RNA序列之后,就激活了Cas13a的RNA酶活性,能够切割其他所遇到的任何RNA,这就是所谓的‘collateral effect’。此时,这个酶就会剪切一个荧光报告基团(quenched fluorescent RNA,实际上是一种高灵敏的检测RNA酶活性的试剂,正常情况下不发光,一旦被RNA酶剪断,就会发光,然后只需要检测到荧光就能够判断是否具有RNA酶活性了),然后发光,其后就可以被检测了。 ? ▲Sherlock技术原理 Sherlock技术中最重要的蛋白质,Cas13a的发现历程是怎样的呢? 实际上,最早在2015年,张锋实验室通过比对class2型的蛋白序列,发现Cas13a与种不同,其不具有Ruvc结构域,即没有DNA酶活性,但是具有两个HEPN结构域,众所周知,HEPN结构域具有RNA酶活性,因此,推测Cas13a具有RNA酶活性。 而他们进一步在2016年4月就在《科学》杂志上面报道了Cas13a是一个RNA介导的RNA酶。 ? ▲张锋团队2016年4月就在《科学》杂志上面报道了Cas13a是一个RNA介导的RNA酶 然而,戏剧性的是,竞争对手杜德拉教授则是在短短几个月之后,就在《Nature》上面发表相关文章。杜德拉实验室更进一步,证明Cas13a具有两种RNA酶活性,一种是切割pre-crRNA称为成熟crRNA酶活性,一种是HEPN结构域的RNA酶活性。 ? ▲杜德拉教授团队则是在短短几个月之后,就在《Nature》上面发表相关文章,第一次将Cas13a应用于基因检测,然而灵敏度太低 当Cas13a和crRNA结合,并识别相应的RNA序列之后,就激活了Cas13a的RNA酶活性,能够切割其他RNA,这就是所谓的‘collateral effect’。因此,他们首次将Cas13a应用于检测RNA,也采用的猝灭荧光的RNA作为报告基团的。然而,当时杜德拉实验室的检测灵敏度仅能够达到nM级别,没有实际应用价值。所以说,单纯使用Cas13a检测灵敏度太低,无使用价值。 http://mp.weixin.qq.com/s/sI24xdNLqC9_5MtrtcfZEw 发自小木虫Android客户端 |
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