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duzhibing

木虫 (小有名气)

[交流] 求教降落PCR程序的设定

我的实验需要用降落PCR程序进行扩增,但是我不会设定降落PCR程序,哪位高手可以把程序设定步骤说一下,不胜感激。我们实验室的PCR仪是Biometra的。
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zl382

铁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
duzhibing(金币+10,VIP+0):谢谢,有两个答案,所以每人10个了,非常感谢! 3-9 09:59
小木虫: 金币+2, 帖子真精彩 2014-04-18 15:21:52
大家好,我最近用到了touchdown PCR程序,一开始不会设置,后来在园子里面搜也没有搜到,昨天折腾了一整天,终于把Biometra PCR仪以及GeneAmp PCR system 2700型号 PCR 仪的touchdown程序都搞明白了。鉴于大家一般用的都是Biometra PCR,我就把Biometra PCR仪的touchdown程序设置写到这里,供大家参考使用。(我以退火温度从65度降到55度为例,每个循环降0.5度,共需20个循环,然后再继续55度退火的5个循环,战友们根据自己情况再调整)
(1)首先是开机打开主页面-----按C键(programme)进入到---列表页面-----通过方向键选择一个subdirect-----按enter进入-----输入你的programme no 和name----再enter----设置lid temp:99度和preheating: on----继续按enter进入---输入
1:94度 5min
2:94度 1min
3:65度 1min(然后连按向右的方向键3下,进入到另一个界面,在
标闪烁处(也就是3的后面)输入-0.5(其上方为dt),
其他的不管,然后,再连续按enter键回到编程的主页
面,此时(65 度 1min 后面会显示一个加号)

4:72度 1min 2 19(Biometra PCR 本身加一个反应即20个循环)
5:94度 1min
6: 55度 1min
7: 72度 1min 5 4(Biometra PCR 本身加一个反应即5个循环)
8:72度 10min
9 :4度 10h
好了,一个touchdown程序就设好了,本来想照了图片对应说,但是借别人的相机,界面照得不清楚,只好这样写出来了,也不知道说清楚了没有。

最后,祝大家试验顺利!
后退,绝对是无路可走!
5楼2009-03-08 19:35:22
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

看说明书嘛………………
没有说明书就上官网找
再不行找销售帮你找……
2楼2009-03-08 16:59:11
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader

降落pcr的程序不是固定的,是根据实验的需要设定的吧,你还是多参考一下相关的文章
会当凌绝顶,一览众山小
3楼2009-03-08 18:29:17
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your2007

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
duzhibing(金币+10,VIP+0):谢谢,有两个答案,所以每人10个了,非常感谢! 3-9 09:59
引用回帖:
Originally posted by sutao1979 at 2009-3-8 18:29:
降落pcr的程序不是固定的,是根据实验的需要设定的吧,你还是多参考一下相关的文章

同样楼上,其实在普通PCR仪上设置降落pcr的程序很简单,只要常规的PCR程序会设计,这就好办,首先根据引物上的Tm值设计第一轮的程序,当然,要选引物所给Tm值低的那个,然后在循环4轮,每轮降1度,在PCR仪上多摸索几次,最后就是设计普通PCR的程序了,比如:
1、95度   5分钟
2、94度    50秒
3、60度   45秒       +(这个加号应该在PCR仪上显示)
4、72度   2分钟     2      5

5、94度    50秒
6、55度   45秒
7、72度   2分钟     5      25
8、72度  10分钟
9、16度   X分钟

[ Last edited by your2007 on 2009-3-8 at 19:31 ]
爱人者被爱,敬人者人敬
4楼2009-03-08 19:29:25
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