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tjegg铁杆木虫 (著名写手)
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[交流]
【讨论】分子内氢键的影响
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我最近的一个试验很有意思： 针对一个已有晶体结构的蛋白，我先用DOCK作了对接，通过不同打分方式，我买了若干化合物，进行生物测试。分子靶向水平，试验证实化合物1好于2；而细胞水平，2好于1。两个化合物均好于阳性对照。随后，我将这两个化合物对接模式抽取出来，使用分子力学和动力学模拟，发现化合物1能形成分子内氢键，这是否能解释分子内氢键，影响了细胞水平的穿膜，从而活性不如分子水平的结果。 因此，我想和大家讨论分子内氢键对生物活性的影响。谢谢。 |
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