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【讨论】分子内氢键的影响
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我最近的一个试验很有意思: 针对一个已有晶体结构的蛋白,我先用DOCK作了对接,通过不同打分方式,我买了若干化合物,进行生物测试。分子靶向水平,试验证实化合物1好于2;而细胞水平,2好于1。两个化合物均好于阳性对照。随后,我将这两个化合物对接模式抽取出来,使用分子力学和动力学模拟,发现化合物1能形成分子内氢键,这是否能解释分子内氢键,影响了细胞水平的穿膜,从而活性不如分子水平的结果。 因此,我想和大家讨论分子内氢键对生物活性的影响。谢谢。 |
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