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lvyanniwin

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】insightII如何加入水溶液环境?

各位好:
      文献中说保持DNA在水溶液环境中,目前使用的软件是insightII,请问如何加入水溶液环境?

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-28 at 13:51 ]
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zuoyinglin

铁杆木虫 (正式写手)


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 3-7 17:01
没用过insightII,我用过amber,里面有相应功能。
分享=快乐 交流=进步
2楼2009-03-07 14:18:13
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superdirac

木虫 (正式写手)


gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢! 3-7 23:53
用namd的话,加水只是一个很简单的命令!呵呵!
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
3楼2009-03-07 20:39:23
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
gwdavid(金币+2,VIP+0):谢谢! 3-7 23:53
1。InsightII中的Discover在做力学和动力学优化时,已经考虑了溶剂效应。
2。可以在体系中加入水盒子,作优化。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2009-03-07 23:41:25
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lvyanniwin(金币+6,VIP+0):o 找的就是这个 3-8 09:16
xuefei06(金币+2,VIP+0):thanks! 3-8 13:56
InsightII中第一行菜单命令在后半部分的传闻至位置有个,菜单名还真忘了,因为不在服务器旁边,没法查,拉下来里面就有个soak的命令就是用来加水的,你看看吧
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
5楼2009-03-07 23:51:19
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dolphin100

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
lvyanniwin(金币+4,VIP+0):很好 3-8 09:21
xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks! 3-8 13:56
assembly  soak  choose the type of water
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
6楼2009-03-08 00:15:49
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