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manjidigege

新虫 (初入文坛)

[求助] 一个左右完全对称的分子,单晶解出来为什么左右不对称呀 已有2人参与

RT,一个小分子模型,左右两个结构单元完全一样,结果在解出的图中却完全不对称,一半符合预期,一半无法理解,请问会不会是解单晶的老师给我解错了呀
要是有高人能帮我解出对称且真实的结构现金酬谢
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
结构没错,实际情况由于热振动等客观情况,不可能是完全对称的
2楼2018-01-26 18:38:11
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)

再说你那个预期的图片是用Chem3D画的吧,自己画当然是可以想画成什么样就画成什么样
3楼2018-01-26 18:40:06
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manjidigege

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by DJ_Tokyo at 2018-01-26 18:40:06
再说你那个预期的图片是用Chem3D画的吧,自己画当然是可以想画成什么样就画成什么样

非常感谢回帖~预期确实是根据计算结果画的,其中的氢键给受体角度与实际测得的上半部分是完全一致的,下半部分弯曲可以理解,但其中的氢键给受体的指向感觉有些难以接受再次感谢
4楼2018-01-26 19:04:40
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by manjidigege at 2018-01-26 19:04:40
非常感谢回帖~预期确实是根据计算结果画的,其中的氢键给受体角度与实际测得的上半部分是完全一致的,下半部分弯曲可以理解,但其中的氢键给受体的指向感觉有些难以接受再次感谢...

既然晶体已经解出来,可以看看其堆积情况
5楼2018-01-26 19:05:43
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果晶体解析的没有问题的话,不对称也很正常,可能是扭角不同降低了对称性,另外氢键,如果氢没有找错的话,其指向就是真是存在的,在合理范围内即可,和预期的不符也正常
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
6楼2018-01-26 19:48:56
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manjidigege

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by DJ_Tokyo at 2018-01-26 19:05:43
既然晶体已经解出来,可以看看其堆积情况...

好的,非常感谢~
7楼2018-01-26 20:15:11
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manjidigege

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2018-01-26 19:48:56
如果晶体解析的没有问题的话,不对称也很正常,可能是扭角不同降低了对称性,另外氢键,如果氢没有找错的话,其指向就是真是存在的,在合理范围内即可,和预期的不符也正常

好的,谢谢,我再看看堆积情况
8楼2018-01-26 21:00:37
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