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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助】EB会与单链DNA结合引起荧光增强吗？
汕头大学海洋科学接受调剂
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gutidog

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】EB会与单链DNA结合引起荧光增强吗？

如题，在实验中发现，在EB溶液中仅仅加入单链引物，也会使荧光有显著增强，一开始怀疑我的引物有问题，后来问订购的那个公司，可是合成部的人告诉我如果单链中有碱基G，EB也能与其结合，是这样吗？后来查资料也没得到具体的答案。不知是否有人碰到过这个问题，请教了，谢谢！
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从一个深渊跳入另一个！
1楼 2009-03-05 12:37:23
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★
350784478(金币+1,VIP+0):感谢参与 9-16 17:17
？？
我只知道EB对单链DNA的嵌入性很差
比如逆转录后的cDNA跑出来是模模糊糊的
还有我做BSP，重亚硫酸盐处理后的DNA跑胶也是模模糊糊的
用EB染
可能用其他染料会好些
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2楼2009-03-05 13:08:01
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hihoney

铁杆木虫 (职业作家)
单链可以用EB染的。
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3楼2009-03-05 13:17:29
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liontears

金虫 (初入文坛)
而且有可能是引物形成二聚体，导致EB的信号强一些。
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4楼2009-03-05 13:38:05
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader
EB主要是和双链DNA结合，但是和单链结合的效率比较低，所以，即使结合的话，荧光检测效果也不会太好。
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会当凌绝顶，一览众山小
5楼2009-03-05 17:11:29
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hihoney

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
单链染色可以看得见，只是小片段要用高浓度的胶才不会有大的扩散。
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6楼2009-09-16 16:04:22
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

有肯呢的吧

★
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我看过的POB上说过单链的RNA可以结合ＥＢ的，但是还没发现有过单链DNA能结合的，看上面的一位老兄说要是二聚的话就有可能，我觉得也有可能，但是一般二聚引物早就跑出去了，我觉得还是自身的聚合可能性跟大些，毕竟有很多的回文结构还是有肯能的，不知道各位同意否？再者，单链DNA也不是没有高级结构啊，就像RNA一样。有了高级结构如果电泳液ｐＨ影响不大，就要粘上ＥＢ了。不尽的地方望大家批评一下。
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7楼2009-09-16 17:06:18
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hihoney

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
跑的引物就可以看得见。

引物都 会有 二聚体 吧。
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8楼2009-09-16 17:51:48
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