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又见萤火虫

新虫 (初入文坛)

[求助] O2PLS相关性分析如何得出相关性系数的p-value 已有1人参与

我采用O2PLS针对微生物组和代谢物组做的相关性分析,并对相关性系数大于0.7的部分进行了讨论,审稿人认为应该进行显著性分析,意见如下: P-values for the all correlations discussed in the text must be assessed using e.g. permutation tests or other statistical tests, and displayed in the manuscript. 我试了进行permutation test 和CV-ANOVA,结果是一个Y值即一个代谢物质对应一个p-value,并不是每个系数一个p-value,请问哪位高手知道SIMCA中是否还有还是有别的计算p-Value的方法?求指导,不胜感激!
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旺仔523

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主,请问需要准备什么样的两个组学的数据矩阵使用simca中的O2PLS进行关联分析?您有教程吗?
国之栋梁
6楼2018-08-30 11:16:56
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星迹

新虫 (初入文坛)

请问楼主解决这个问题了吗?我也想请教一下
2楼2018-02-01 16:05:12
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又见萤火虫

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 星迹 at 2018-02-01 16:05:12
请问楼主解决这个问题了吗?我也想请教一下

后来用R语言做了pearson相关性分析,得到的相关性系数和SIMCA的结果一样,同时也得到了p-value,提交修改稿了,希望审稿人能够给过!
3楼2018-02-01 22:57:57
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又见萤火虫

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 星迹 at 2018-02-01 16:05:12
请问楼主解决这个问题了吗?我也想请教一下

后来用R做了Pearson相关性分析,所得的相关性系数和SIMCA一致,同时得到了p-value,修改稿提交了,祈祷审稿人给过
4楼2018-02-01 23:00:07
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