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又见萤火虫

新虫 (初入文坛)

[求助] O2PLS相关性分析如何得出相关性系数的p-value 已有1人参与

我采用O2PLS针对微生物组和代谢物组做的相关性分析，并对相关性系数大于0.7的部分进行了讨论，审稿人认为应该进行显著性分析，意见如下： P-values for the all correlations discussed in the text must be assessed using e.g. permutation tests or other statistical tests, and displayed in the manuscript. 我试了进行permutation test 和CV-ANOVA，结果是一个Y值即一个代谢物质对应一个p-value,并不是每个系数一个p-value，请问哪位高手知道SIMCA中是否还有还是有别的计算p-Value的方法？求指导，不胜感激！
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1楼 2018-01-20 16:40:14
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星迹

新虫 (初入文坛)
请问楼主解决这个问题了吗？我也想请教一下
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2楼2018-02-01 16:05:12
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又见萤火虫

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 星迹 at 2018-02-01 16:05:12
请问楼主解决这个问题了吗？我也想请教一下

后来用R语言做了pearson相关性分析，得到的相关性系数和SIMCA的结果一样，同时也得到了p-value，提交修改稿了，希望审稿人能够给过！
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3楼2018-02-01 22:57:57
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又见萤火虫

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 星迹 at 2018-02-01 16:05:12
请问楼主解决这个问题了吗？我也想请教一下

后来用R做了Pearson相关性分析，所得的相关性系数和SIMCA一致，同时得到了p-value，修改稿提交了，祈祷审稿人给过
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4楼2018-02-01 23:00:07
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星迹

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 又见萤火虫 at 2018-02-01 23:00:07
后来用R做了Pearson相关性分析，所得的相关性系数和SIMCA一致，同时得到了p-value，修改稿提交了，祈祷审稿人给过...

祝你好运

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5楼2018-02-02 14:38:24
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旺仔523

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主，请问需要准备什么样的两个组学的数据矩阵使用simca中的O２PLS进行关联分析？您有教程吗？
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国之栋梁
6楼2018-08-30 11:16:56
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1893-

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 旺仔523 at 2018-08-30 11:16:56
楼主，请问需要准备什么样的两个组学的数据矩阵使用simca中的O２PLS进行关联分析？您有教程吗？

你现在会了吗？我也想请教一下

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7楼2019-03-29 17:28:41
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1893-

新虫 (小有名气)
楼主有没有关于关联分析的教程可以分享的啊？

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8楼2019-03-29 17:29:17
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