应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】计算聚合物分子间氢键
101/1返回列表
查看: 446  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

466902981

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】计算聚合物分子间氢键

我想做聚合物分子间的氢键，可以肯定分子间氢键是一定存在的，但无论怎么算都算不出是怎么回事？ 该怎么办呢？

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 21:18 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2009-03-04 12:59:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llyshc

银虫 (正式写手)
★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！我用PCFF力场，会计算氢键吗？ 3-4 16:49
嗯，你用的什么力场？有些力场并没有把氢键单独拎出来算的，这样你在结果里看不到氢键项就很正常。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-03-04 13:26:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
有时候，我就是单独计算氢键，只能找到分子内的，但分子间的也显示不出，为什么呢？
赞一下 回复此楼
3楼2009-03-04 16:51:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llyshc

银虫 (正式写手)

要看力场算的结果里有没有氢键项啊

★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！在哪设置打开氢键选项啊？ 3-5 09:45
如果你设置了关掉氢键显示项，那即使有氢键，也不会显示的。
但力场的计算结果是很清楚的。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-03-04 18:43:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by llyshc at 2009-3-4 18:43:
如果你设置了关掉氢键显示项，那即使有氢键，也不会显示的。
但力场的计算结果是很清楚的。

请问怎么打开？谢谢！
赞一下 回复此楼
5楼2009-03-11 09:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)
★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！请问怎么统计呢？ 3-11 11:12
ms本身貌似不输出，需要自己统计
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2009-03-11 11:03:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llyshc

银虫 (正式写手)

嗯，我帮你看了一下，可以试试这个。

★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！ 3-11 14:46
在ms的界面中的build菜单中选择hydrogen bonds选项，会弹出对话框，你自己可以设定氢键规则，然后点击calculate，就可以算出氢键。
赞一下 回复此楼
7楼2009-03-11 11:54:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by llyshc at 2009-3-11 11:54:
在ms的界面中的build菜单中选择hydrogen bonds选项，会弹出对话框，你自己可以设定氢键规则，然后点击calculate，就可以算出氢键。

谢谢，这个我知道，我搞不懂的是，本来已经用实验证明分子间氢键是存在的，可用MS就是做不出，只能显示分子内氢键，该怎么办呢？
赞一下 回复此楼
8楼2009-03-11 14:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-3-11 11:03:
ms本身貌似不输出，需要自己统计

以前没涉及过编程，我该怎么着手呢？谢谢！
赞一下 回复此楼
9楼2009-03-12 14:08:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢 O(∩_∩)O 3-12 21:35
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！ 3-16 11:11
1、弄清计算化学里的氢键定义
2、弄清MS轨迹文件结构
然后就可以编程计算了
赞一下(11人) 回复此楼
10楼2009-03-12 14:29:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 466902981 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +12 archer.. 2026-04-10 13/650 2026-04-11 08:44 by zhq0425
[考研] 一志愿西北工业大学289 085602 +31 yang婷 2026-04-10 31/1550 2026-04-11 00:19 by gong120082
[考研] 一志愿华南理工大学331分材料求调剂 +9 天下ww 2026-04-09 9/450 2026-04-10 22:58 by Ftglcn90
[考研] 283求调剂 +21 那个噜子 2026-04-09 21/1050 2026-04-10 21:18 by zhouxiaoyu
[考研] 求调剂 +16 熊二想上岸 2026-04-04 16/800 2026-04-10 11:24 by may_新宇
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +22 土豆er? 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 10:58 by 高维春
[考研] 青岛科技大学材料学院，环境学院调剂补录4月10日以前都可以 +3 1青科大。 2026-04-09 5/250 2026-04-10 09:58 by 翩翩一书生
[考研] 生物与医药调剂 +5 十七sa 2026-04-05 5/250 2026-04-10 08:14 by kangsm
[考研] 调剂 +8 只叙离别辞 2026-04-09 10/500 2026-04-09 20:25 by zl8213662
[考研] 284求调剂 +7 让我上岸吧阿西 2026-04-09 7/350 2026-04-09 18:59 by haironglove
[考研] 材料调剂 +10 18815505510 2026-04-09 11/550 2026-04-09 17:07 by 544594351
[考研] 生物学学硕，初试351分，求调剂 +4 …～、王…～ 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:49 by limeifeng
[考研] 0703调剂，一志愿天津大学319分 +23 haaaabcd 2026-04-05 26/1300 2026-04-08 16:19 by luoyongfeng
[考研] 315求调剂 +17 欣喜777 2026-04-04 18/900 2026-04-08 13:54 by hangsimei
[考研] 081200-11408-367学硕求调剂 +4 1_2_3111 2026-04-06 4/200 2026-04-07 08:13 by jp9609
[考研] 302分求调剂 一志愿安徽大学085601 +12 zyx上岸！ 2026-04-04 12/600 2026-04-07 02:09 by BruceLiu320
[考研] 工科 22408 267求推荐 +4 wanwan00 2026-04-05 5/250 2026-04-06 22:47 by chenzhimin
[考研] 071000生物学调剂 +7 拉提桃 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:55 by 52305043001
[考研] 285求调剂 +8 AZMK 2026-04-04 11/550 2026-04-06 13:56 by BruceLiu320
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 22:23 by hemengdong
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭