应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】计算聚合物分子间氢键
101/1返回列表
查看: 392  |  回复: 9
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

466902981

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】计算聚合物分子间氢键

我想做聚合物分子间的氢键，可以肯定分子间氢键是一定存在的，但无论怎么算都算不出是怎么回事？ 该怎么办呢？

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 21:18 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼2009-03-04 12:59:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llyshc

银虫 (正式写手)
★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！我用PCFF力场，会计算氢键吗？ 3-4 16:49
嗯，你用的什么力场？有些力场并没有把氢键单独拎出来算的，这样你在结果里看不到氢键项就很正常。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-03-04 13:26:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
有时候，我就是单独计算氢键，只能找到分子内的，但分子间的也显示不出，为什么呢？
赞一下 回复此楼
3楼2009-03-04 16:51:15
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llyshc

银虫 (正式写手)

要看力场算的结果里有没有氢键项啊

★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！在哪设置打开氢键选项啊？ 3-5 09:45
如果你设置了关掉氢键显示项，那即使有氢键，也不会显示的。
但力场的计算结果是很清楚的。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-03-04 18:43:15
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by llyshc at 2009-3-4 18:43:
如果你设置了关掉氢键显示项，那即使有氢键，也不会显示的。
但力场的计算结果是很清楚的。

请问怎么打开？谢谢！
赞一下 回复此楼
5楼2009-03-11 09:14:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)
★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！请问怎么统计呢？ 3-11 11:12
ms本身貌似不输出，需要自己统计
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2009-03-11 11:03:09
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llyshc

银虫 (正式写手)

嗯，我帮你看了一下，可以试试这个。

★
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！ 3-11 14:46
在ms的界面中的build菜单中选择hydrogen bonds选项，会弹出对话框，你自己可以设定氢键规则，然后点击calculate，就可以算出氢键。
赞一下 回复此楼
7楼2009-03-11 11:54:40
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by llyshc at 2009-3-11 11:54:
在ms的界面中的build菜单中选择hydrogen bonds选项，会弹出对话框，你自己可以设定氢键规则，然后点击calculate，就可以算出氢键。

谢谢，这个我知道，我搞不懂的是，本来已经用实验证明分子间氢键是存在的，可用MS就是做不出，只能显示分子内氢键，该怎么办呢？
赞一下 回复此楼
8楼2009-03-11 14:48:04
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

466902981

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-3-11 11:03:
ms本身貌似不输出，需要自己统计

以前没涉及过编程，我该怎么着手呢？谢谢！
赞一下 回复此楼
9楼2009-03-12 14:08:00
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢 O(∩_∩)O 3-12 21:35
466902981(金币+1,VIP+0):谢谢！ 3-16 11:11
1、弄清计算化学里的氢键定义
2、弄清MS轨迹文件结构
然后就可以编程计算了
赞一下(11人) 回复此楼
10楼2009-03-12 14:29:57
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 466902981 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭