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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock对接结合能分布特别广，从-5到-9都有怎么办？
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三百烦恼风

银虫 (小有名气)
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autodock对接结合能分布特别广，从-5到-9都有怎么办？
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对接了50次，大概有十几个能量，分布得特均匀。这是为啥？是我处理的有问题，还是小分子药物根本没有抑制效果？

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1楼 2018-01-14 21:21:32
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三百烦恼风

银虫 (小有名气)
找最优构象是要同时考虑最低结合能，和聚类里次数最多的构象吧。现在分布特别广，怎么办？求教

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18楼2018-01-14 21:52:30
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longdlut

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可以增加对接次数，或者修改对接参数

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三百烦恼风
25楼2018-01-15 09:16:11
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三百烦恼风

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
25楼: Originally posted by longdlut at 2018-01-15 09:16:11
可以增加对接次数，或者修改对接参数

修改对接参数指的是什么参数？gridbox的大小吗？
感觉增加对接次数也没有用，试过增加到200次，还是范围很宽，高低区分也不大。
有的小分子对接就区分很明显，是不是还是小分子的原因。

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26楼2018-01-15 10:57:48
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pandongzi2楼
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lldf103楼
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zbg2190014楼
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panda6686楼
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Andy^?_?^7楼
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smile5238楼
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超越时空幻想9楼
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tiantianmm10楼
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润色论文11楼
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BraveSophia12楼
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daqing101813楼
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liuxun500014楼
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刘春雨16楼
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wuyuqicas17楼
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star1991112819楼
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Triumph101120楼
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dlli201422楼
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东川一霸23楼
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XIAOmutong924楼
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