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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 采用BLASTp 对菌株进行共有基因和特异基因的分析
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BALOs

新虫 (小有名气)

[求助] 采用BLASTp 对菌株进行共有基因和特异基因的分析 已有2人参与

请问有谁知道如何采用BLASTp 对菌株进行共有基因和特异基因的分析呢？具体怎么操作，结果如何分析呢？或者有没有人可以做相关分析的，有偿！
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1楼 2018-01-12 13:28:44
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BALOs

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zyz2007 at 2018-01-16 08:18:44
你指的是有多个基因组，然后找他们的共有基因和特异基因吗？pan genome分析？这个不困难啊，多个软件可以做的

您好，是的，我只测了一株细菌的全基因组草图，然后在NCBI里下载了几株菌的序列，想找到他们的共有和特异基因。请问哪些软件可以呢，？我没有安装Linus系统，有些软件用不了

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3楼2018-01-16 08:31:38
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zyz2007

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你指的是有多个基因组，然后找他们的共有基因和特异基因吗？pan genome分析？这个不困难啊，多个软件可以做的
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2楼2018-01-16 08:18:44
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enjoy大志

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

直接NCBI——Blast就可以
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BALOs
付出定有回报
4楼2018-01-16 16:27:49
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BALOs

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by enjoy大志 at 2018-01-16 16:27:49
直接NCBI——Blast就可以

您好，感谢您的回复，请问您能否具体说一下，本人刚接触这些，只是在文献上看到有用BLASTp 对菌株进行共有基因和特异基因的分析，不胜感激！
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5楼2018-01-16 21:19:09
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