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BALOs

新虫 (小有名气)

[求助] 采用BLASTp 对菌株进行共有基因和特异基因的分析 已有2人参与

请问有谁知道如何采用BLASTp 对菌株进行共有基因和特异基因的分析呢?具体怎么操作,结果如何分析呢?或者有没有人可以做相关分析的,有偿!
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zyz2007

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你指的是有多个基因组,然后找他们的共有基因和特异基因吗?pan genome分析?这个不困难啊,多个软件可以做的
2楼2018-01-16 08:18:44
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BALOs

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zyz2007 at 2018-01-16 08:18:44
你指的是有多个基因组,然后找他们的共有基因和特异基因吗?pan genome分析?这个不困难啊,多个软件可以做的

您好,是的,我只测了一株细菌的全基因组草图,然后在NCBI里下载了几株菌的序列,想找到他们的共有和特异基因。请问哪些软件可以呢,?我没有安装Linus系统,有些软件用不了

发自小木虫Android客户端
3楼2018-01-16 08:31:38
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enjoy大志

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

直接NCBI——Blast就可以

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

付出定有回报
4楼2018-01-16 16:27:49
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BALOs

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by enjoy大志 at 2018-01-16 16:27:49
直接NCBI——Blast就可以

您好,感谢您的回复,请问您能否具体说一下,本人刚接触这些,只是在文献上看到有用BLASTp 对菌株进行共有基因和特异基因的分析,不胜感激!
5楼2018-01-16 21:19:09
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