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喵酱01

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于力场、配体 已有1人参与

各位前辈好,在这求教几个问题≧﹏≦
1. pdb数据库中结晶的a淀粉酶的底物的名字是 BGC、DAF和GLC,请问BGC和GLC的区别是什么?DAF是什么?
2. 我用的chamm27力场,力场文件aminoacids.rtp文件中没有ca和cl离子数据,运行pdb2gmx时系统默认cl是个氨基酸,报错,这种情况应该怎么处理?。。。我比较疑惑的是,以前模拟平衡电荷时也会替换cl离子,明明是有的呀。。。请前辈们解答一下,感谢!

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喵酱01

新虫 (初入文坛)

我第一次发忘了给金币到时候给大佬补发呀

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2楼2018-01-09 17:36:06
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awaken2013

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
配体底物区别看pdb数据库 晶体结构下面会有些。cl识别错误 就把他删掉 就这么简单

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3楼2018-01-12 22:59:37
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