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mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手

[交流] 【求助】DNA+小分子动力学模拟能完成吗

我想模拟DNA分子和合成小分子之间的作用?如:静电作用、氢键作用、π-π作用....通过动力学模拟能达到目的吗?如果可以,用哪个软件比较合适。给出建议,就有金币略表谢意。谢谢大家。

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-28 at 13:51 ]
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新手学习
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superdirac

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 3-3 15:42
mengxianggao(金币+1,VIP+0):谢谢 3-4 14:40
namd + vmd  
  学起来可能有点麻烦!
要是容易上手的就是 Amber 吧!!
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
5楼2009-03-03 13:54:10
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superdirac

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 3-3 15:43
mengxianggao(金币+1,VIP+0):谢谢 3-4 14:41
namd 的参数绝大部分是给生物大分子.对于有机小分子参数很少.
当然并不一定没有,假如要是生物大分子(蛋白质,核酸,生物膜)的一部分,可以直接拿现成的参数用.要是没有拿可能就没有了!
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
6楼2009-03-03 13:56:52
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