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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 分子动力学跑同源二聚体蛋白，为何会跑散？
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大姚

金虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学跑同源二聚体蛋白，为何会跑散？

小弟最近用Schrodinger中的Desmond软件包跑一个同源二聚体蛋白复合物的分子动力学，结果发现最终两个亚基分离了，这是什么原因？需要修改什么参数呢？
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我的地盘听我的！
1楼 2018-01-04 14:55:10
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awaken2013

铜虫 (小有名气)
sc不太熟悉 你可以换gmx跑跑 用amber或charmm力场 一般来说结晶的二聚体跑散的可能比较低

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2楼2018-01-07 01:39:17
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