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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 【求助】GaussianView反映的键连关系有误
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ZJboy

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】GaussianView反映的键连关系有误

有没试过用GV画出来的结构转化来的内坐标不反映实际键连关系的情况？
例如1，2，4-三氮唑中第1、2位原子都是碳，但他们明显不相连。请问该怎么办？谢谢。

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 18:58 ]
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1楼 2009-03-01 21:05:29
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ZJboy

木虫 (著名写手)
在G03手册上有这样一段话：
坐标系统选择选项
Z-matrix 用内坐标系统进行优化计算。在这种情况中，关键字Fopt 而不是Opt 要
求程序确认进行了完全优化(即，包含非活性变量在内的变量之间是线性
无关的，并且自由度的范围被分子对称性所允许)。Popt 形式要求进行内
坐标的部分优化。在优化结束后它还支持频率分析，这包含每个点的二
阶导数(使用CalcAll选项）

能否解释第一个括号的内容？
以及列举一些可能用了fopt=z-matrix  反而可能导致出错的例子？

非常感谢。
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7楼2009-03-03 22:14:31
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks！ 3-1 23:23
你用chemcal draw画吧 只要画得好 比高斯view好多了 方便快捷
赞一下(10人) 回复此楼
我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
2楼2009-03-01 22:34:47
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks！ 3-1 23:23
量子化学中似乎只关心两个原子之间的距离，而不管它们之间会是什么样的键合方式，这只是显示程序应该考虑的问题
赞一下(10人) 回复此楼
3楼2009-03-01 22:46:01
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ZJboy

木虫 (著名写手)
如果优化成功，那么结果用高斯View看还是没问题的。
但会不会影响红外频率等，以及发表论文时阐述优化所得结果应把结构的真实键连表示出来吧。
赞一下 回复此楼
4楼2009-03-01 23:00:12
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