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新虫 (初入文坛)

[求助] 请教大神,两种细菌共培养如何定量每种菌? 已有4人参与

想做两种菌的互作。打算液体共培养,但不知道如何测共培养过程中两种菌各自的生物量。

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mircoakk

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by snoopytbw at 2017-12-21 08:51:44
共培养通常用的是overlay。液体培养不太好做啊,构建GFP的话,很可能会改变菌株的性状,我建议是用FISH,荧光探针法。或者简单点,直接qPCR,定量分析,记得要加2组内参

想问一下,做qPCR的话,是直接用DNA还是反转录成cDA呢?目的基因应该怎么选择呢?内参的目的是什么?求大神指点

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9楼2017-12-26 14:12:42
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duanxke2014

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是常用的细菌,例如E.coli S. aureus或Bacillus 这些有遗传操作的菌还是环境中分离的菌?如果是常用菌,可以构建荧光蛋白,通过对荧光量进行定量分析。如果是环境分离的菌,可以用半透膜将两种菌隔离,使其能够感应对方存在,而不会混合。
2楼2017-12-21 05:29:05
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
共培养通常用的是overlay。液体培养不太好做啊,构建GFP的话,很可能会改变菌株的性状,我建议是用FISH,荧光探针法。或者简单点,直接qPCR,定量分析,记得要加2组内参
3楼2017-12-21 08:51:44
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果不同的菌,直接分析混菌中16SRNA占比就好了吧,就像宏基因组那样~如果是相同菌经过改造之后混菌的话,就比较麻烦了,得找特应性的特征~
···
4楼2017-12-21 14:15:37
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