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请教大神,两种细菌共培养如何定量每种菌?
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请教大神,两种细菌共培养如何定量每种菌?
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想做两种菌的互作。打算液体共培养,但不知道如何测共培养过程中两种菌各自的生物量。
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2017-12-20 13:41:22
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14楼
:
Originally posted by
mircoakk
at 2017-12-28 00:30:32
关键是没有人做过体外培养证明过它们有共生关系,我们是根据肠道菌群16s结果,预测出来的。而且这种预测只能确定到菌属,无法确定到某一种菌株。现在就是想做,这个预测结果的验证实验,却无从下手
...
这个,不太懂预测了。。。如果是菌群,不太好做验证,不妨你试试FISH吧,比如A和B共生的话,分别设计A和B的特异性序列互补的DNA探针就好了,混合菌,加探针,如果两种荧光都有,就是共生吧,我是这么理解的
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16楼
2018-01-08 09:08:48
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是常用的细菌,例如E.coli S. aureus或Bacillus 这些有遗传操作的菌还是环境中分离的菌?如果是常用菌,可以构建荧光蛋白,通过对荧光量进行定量分析。如果是环境分离的菌,可以用半透膜将两种菌隔离,使其能够感应对方存在,而不会混合。
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2楼
2017-12-21 05:29:05
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共培养通常用的是overlay。液体培养不太好做啊,构建GFP的话,很可能会改变菌株的性状,我建议是用FISH,荧光探针法。或者简单点,直接qPCR,定量分析,记得要加2组内参
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3楼
2017-12-21 08:51:44
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如果不同的菌,直接分析混菌中16SRNA占比就好了吧,就像宏基因组那样~如果是相同菌经过改造之后混菌的话,就比较麻烦了,得找特应性的特征~
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···
4楼
2017-12-21 14:15:37
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