24小时热门版块排行榜    

查看: 834  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Stark1234567

新虫 (小有名气)


已领完
ChIP
领取红包 (小木虫手机app专属红包)

扫一扫,下载小木虫客户端

磁珠分选后得到的T细胞,想做转录因子与启动子结合的验证,选用哪种ChIP试剂盒合适?酶解法还是超声法好?谢谢!

发自小木虫Android客户端

[ Last edited by Stark1234567 on 2017-12-14 at 00:10 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yxijaier

铜虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1. 酶解法对于交联固定后的DNA处理效果不如超声法高效,同时酶法在37°C孵育样品可能会导致蛋白表位的降解;

2. 酶切获得的DNA片段相对较短,不适合ChIP-chip,ChIP-Seq实验;

3. 酶法获得的DNA片段相对较短,对于后续样品的PCR扩增和检测带来更多的困难;

4. 酶切消化主要发生在核小体之间,并不是随机消化,对于一些基因如P53并不适合,因为蛋白结合位点位于核小体间的DNA linker序列中;

5. 超声对DNA的裂解是随机的,对于实验重复性高于酶法处理;

6. 部分研究者显示酶切方法不如超声敏感,可能酶法对部分染色质DNA的消化不如超声方法对细胞的裂解更加彻底,因此获得的DNA的量会较超声低一些;

7. 对于表达丰度较低的或与DNA结合不紧密的蛋白,如当前研究最多的转录因子,调控因子等。往往需要用交联试剂将样本(细胞or组织)进行固定,稳定蛋白质和DNA的形态,这时最好选用超声法进行断裂。 

8. 研究蛋白为转录因子是,慎用酶解法。因为有的转录因子较大,DNA结合区域覆盖多个核小体,酶切法会将结合区域打碎
9楼2017-12-15 10:05:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

Yxijaier

铜虫 (小有名气)


针对试剂盒,目前市面上的试剂盒做做组蛋白还凑合,转录因子还没有特别合适的,尤其是表达量低的,可能一个试剂盒都用完了还富集不到多少
10楼2017-12-15 10:07:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2017-12-14 00:06   回复  
Stark1234567(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
2017-12-14 00:08   回复  
Stark1234567(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
tscdtc8楼
2017-12-14 00:08   回复  
Stark1234567(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫IOS客户端
Thomas_Lo6楼
2017-12-14 00:07   回复  
Stark1234567(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
2017-12-14 00:07   回复  
Stark1234567(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
2017-12-14 00:07   回复  
Stark1234567(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
2017-12-14 00:07   回复  
Stark1234567(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+5 David1982 2026-10-13 8/400 2026-10-14 21:38 by lhw_GPA4.0
[硕博家园] 中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理 +3 sujiner 2026-10-08 4/200 2026-10-14 20:40 by qicaiyun
[职场人生] 40+中年人失业后,还能找到好工作吗? +3 xqy2009 2026-10-13 3/150 2026-10-14 20:17 by 43358052
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见