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为什么选择他?16S rDNA 已有1人参与
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最近两年,在医学、农业、畜牧业、林业等行业中,微生物多样性研究变得火热起来。 不管是环境方面(水、土、空气、植物等)还是人体方面(肠道、皮肤、口腔等),样本中的微生物绝大多数是细菌。 小马刚到公司时,就被告知, 如果客户检测细菌,那就检测16S rDNA。 DNA、RNA是遗传物质, 这个rDNA、16S是什么?为什么选择他呢? rDNA是编码rRNA的基因。 rRNA(核糖体RNA)是最多的一类RNA,占RNA量的82%左右。 在细胞中的量比较多! S是沉降系数,当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时,此速度与粒子的大小直径成比例。 在原核生物中,rRNA有3类,5S(120bp)、16S(1540bp)和23S(2900bp)。 真核生物中,rRNA有4类,5S(120bp)、5.8S(160bp)、18S(1900bp)、和28S(4700bp)。 1540bp,长度适中! 再看看他的结构, 有9个保守区,9个可变区。 意味着,既能分清上面是狗、下面是猫(保守区),又能区分这个左上是哈士奇右上是中华田园犬(变异区)。 这3个特点, 让16S rRNA gene成为检测细菌的首选目标。 但由于RNA不稳定,很容易降解, 所以在检测多样性时,选择提取DNA, 检测编码rRNA gene的 rDNA! 毕竟两者携带的信息是一样的, 而我们想要的也只是ATCG这些神秘的信息。 想要了解更多科研知识和信息, 请关注我们小马科研部落。 发自小木虫IOS客户端 |
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