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erictan2046

铜虫 (正式写手)

[交流] [求助]引物5’酶切位点怎么加?

我是在Premier5.0软件上加了酶切位点之后发现原来配对的引物不配对了,是不是不用管它?在软件上加了酶切位点却不配对了,怎么办?

谢谢。
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

旁边不还有个analyze的什么按钮吗?点一下,会自动帮你对齐
2楼2009-02-24 19:14:37
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erictan2046

铜虫 (正式写手)

还是不会!你具体说哪个扭吧!

还是不行!
3楼2009-02-24 20:44:07
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chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫

★ ★
lwf991229(金币+2,VIP+0):感谢提供帮助~ 2-24 21:12
楼主不用这么麻烦啊 5‘端酶切位点直接手加上就行了 比如我的For引物为 GGTAGCCTAGCTGGAT 要加一个EcoRI的 EcoRI是GAATTC吧我忘了 假设是 那就最后变成 GAATTC GGTAGCCTAGCTGGAT 最后别忘加保护碱基 EcoRI 两个就行 有的要三个才切得开 那就变成 CTT GAATTC GGTAGCCTAGCTGGAT 前面的不影响退火
Rev引物要按原序列反向互补写 写完了仍然是正的 左端是5 也是这样加
然后发邮件给公司
Bemühen Sie !
4楼2009-02-24 21:01:07
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

edit primer

analyze
primer
5楼2009-02-24 23:43:24
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小猫三两只

金虫 (正式写手)

4楼
嗯,我平时设计引物就是这样做的,保护碱基和酶切位点的碱基不会影响退火温度.只要你设计的对就行了,剩下的直接加上就可以了
6楼2009-02-25 10:38:21
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muchong5577

金虫 (正式写手)


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论,~ 2-25 15:18
楼主 告诉你个方法
把你的序列粘贴到Premier5.0里后,再到你的序列前后添加几个N,比如酶切位点有6 个碱基,你就加6个N,然后在设计引物。
7楼2009-02-25 15:15:24
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

我的方法最直观居然没jb………………
8楼2009-02-25 15:29:12
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erictan2046

铜虫 (正式写手)

好的。

谢谢你们
9楼2009-02-25 16:02:52
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